Đây là lệnh bp_process_sgdp có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
bp_process_sgd.pl - Biến đổi các tập tin phẳng chú thích SGD thành một phiên bản phù hợp với
Trình duyệt gen chung
SYNOPSIS
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > men.gff
MÔ TẢ
Tập lệnh này sắp xếp các tệp phẳng chú thích chuỗi SGD nằm ở
ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/data_dump/feature/chromosomal_features.tab thành một
phiên bản có định dạng GFF phù hợp để trình duyệt bộ gen chung hiển thị.
Để sử dụng tập lệnh này, hãy lấy tệp SGD chromosomal_features.tab từ trang FTP được liệt kê
ở trên và chạy lệnh sau:
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > men.gff
Sau đó, tệp men.gff có thể được tải vào cơ sở dữ liệu Bio::DB::GFF bằng cách sử dụng như sau
chỉ huy:
% số lượng lớn_load_gff.pl -d men.gff
Sử dụng bp_process_sgdp trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net