Đây là lệnh geneparse-mpi có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
geneparse - giao diện người dùng trình tải tệp trình tự
ĐỒNG BỘ
geneparse [tùy chọn ...] [input] [input2 ...] #read input và ghi vào stdout
MÔ TẢ
Đọc một tệp trình tự và ghi nó vào đâu đó (theo mặc định là stdout).
Một phạm vi cụ thể trong tệp đầu vào có thể được chỉ định bởi tệp [bắt đầu, dừng]. Hình vuông
dấu ngoặc có thể được thay thế cho bất kỳ {[()]} nào, (ví dụ: "genome.fa [3000,4000]" hoặc
"genome.fa {3000 ~ 4000}"). Hãy lưu ý rằng tất cả những thứ đó có thể được phân tích cú pháp bởi shell của bạn. Cũng
bất kỳ ký tự không phải từ nào cũng có thể được sử dụng để phân tách các số.
LỰA CHỌN
--repeatmask | -r
sử dụng trình tự lặp lại mềm (nghĩa là: thay thế các cơ sở chữ thường bằng N).
--upper | --unmask | -U
viết hoa tất cả các bazơ.
- độ dài | -l
chỉ cần in độ dài và thoát ra
--clean | -c
không nối thêm một dòng mới khi đã hoàn thành
--version | -V
in phiên bản chương trình
- trợ giúp | -h
in một thông báo trợ giúp
- đầu ra | -o
gửi đầu ra đến một tệp (nếu không thì sử dụng stdout). --output ngụ ý - trong sạch.
--quiet | -q
im lặng tất cả các cảnh báo
--verbose | -v
in nhiều chi tiết bổ sung
Sử dụng geneparse-mpi trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net