Đây là lệnh kmc_tools-counters_subtract có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
kmc_tools-counters_subtract - tính trừ bộ đếm của hai cơ sở dữ liệu KMC
SYNOPSIS
kmc_tools quầy_trừ <output
[output_params]>
MÔ TẢ
Cơ sở dữ liệu đầu ra sẽ chỉ chứa k-mers có trong tập đầu vào đầu tiên và
có bộ đếm cao hơn k-mers thích hợp trong tập thứ hai. Đối với mỗi k-mer,
bộ đếm bằng hiệu giữa bộ đếm trong bộ đầu tiên và bộ đếm trong
bộ thứ hai.
LỰA CHỌN
Đối với mỗi đầu vào có các tham số bổ sung:
-ci
loại trừ k-mers xảy ra ít hơn lần
-cx
loại trừ k-mers xảy ra nhiều hơn lần
Đối với đầu ra, có các tham số bổ sung:
-ci
loại trừ k-mers xảy ra ít hơn lần
-cx
loại trừ k-mers xảy ra nhiều hơn lần
-cs
giá trị tối đa của bộ đếm
THÍ DỤ
kmc - k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_bộ đếm công cụ_trừ kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
Sử dụng kmc_tools-counters_subtract trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net