Đây là ứng dụng Linux có tên GMOL để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng gmol_1.1.jar. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên GMOL này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
GMOL để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
GMOL là một ứng dụng được thiết kế để hình dung cấu trúc bộ gen dưới dạng 3D. Nó cho phép người dùng xem cấu trúc bộ gen ở nhiều tỷ lệ, bao gồm: toàn cầu, nhiễm sắc thể, locus, sợi, nucleosome và nucleotide. Phần mềm này được xây dựng dựa trên gói Jmol có sẵn bởi nhóm của GS Cheng.Phần mềm được phát triển trong Phòng thí nghiệm Tin sinh học, Khai thác Dữ liệu và Máy học của Giáo sư Jianlin Cheng tại Khoa Khoa học Máy tính tại Đại học Missouri - Columbia, Hoa Kỳ. Dự án được hỗ trợ bởi Quỹ Khoa học Quốc gia (tài trợ số DBI1149224).
Nếu bạn sử dụng GMOL trong nghiên cứu của mình, vui lòng trích dẫn:
Nowotny, Jackson, Avery Wells, Oluwatosin Oluwadare, Lingfei Xu, Renzhi Cao, Tuan Trieu, Chenfeng He và Jianlin Cheng. "GMOL: một công cụ tương tác để hình dung cấu trúc bộ gen 3D." Báo cáo khoa học 6 (2016): 20802.
Tính năng
- Trực quan hóa cấu trúc bộ gen trong 3D một cách tương tác
- Hỗ trợ nhiều tỷ lệ / độ phân giải: toàn cầu, nhiễm sắc thể, locus, sợi, nucleosome, nucleotide
- Đo khoảng cách và góc giữa các điểm trong cấu trúc
- Xoay và mở rộng mô hình để phân tích chúng nhiều hơn
- Chọn các phần của cấu trúc dựa trên thông tin chỉ mục, tỷ lệ hoặc trình tự
- Nhận trình tự DNA cho các cấu trúc hoặc phần cấu trúc đã chọn
- Bao gồm các chức năng Jmol hiện có
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Kỹ thuật
Ngôn ngữ lập trình
Java
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/gmol/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
