Đây là ứng dụng Linux có tên raxmlGUI có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng raxmlGUI1.5b3.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên raxmlGUI này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
raxmlGUI
MÔ TẢ
LƯU Ý RELEASE: Tải raxmlGUI 2.0 tại VỊ TRÍ DỰ ÁN MỚI: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/raxmlGUI là giao diện người dùng đồ họa cho RAxML, một trong những phần mềm phổ biến và được sử dụng rộng rãi nhất để suy luận phát sinh loài sử dụng khả năng tối đa.
Giao diện người dùng đồ họa thân thiện với người dùng để phân tích phát sinh loài sử dụng RAxML (Stamatakis, 2006). Vui lòng trích dẫn: Silvestro, Michalak (2012) - raxmlGUI: giao diện người dùng đồ họa cho RAxML. Sự đa dạng và tiến hóa của sinh vật 12, 335-337. DOI: 10.1007 / s13127-011-0056-0
Tính năng
- * PHIÊN BẢN MỚI 2.0 BÂY GIỜ ĐÃ CÓ: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/*
- * phiên bản 1.5 * bổ sung khả năng chạy phân tích thông qua Cổng Khoa học CIPRES
- GUI bao gồm các tệp thực thi RAxML
- Khả năng tương thích đa dạng (Mac OS, Windows, Linux)
- Yêu cầu Python 2.6, 2.7
- Giao diện trực quan để phân vùng dữ liệu và lựa chọn nhóm ngoài
- Lựa chọn mô hình cho các liên kết DNA, axit amin, nhị phân và đa trạng thái
- Tự động chuyển đổi NEXUS sang PHYLIP (và ngược lại)
- Nhập tệp FASTA
- Xây dựng lại trạng thái tổ tiên
- Chức năng "Bootstopping" (Pattengale et al. 2010)
- Loại trừ tương tác của các trang web
- Kết hợp nhiều căn chỉnh với phân vùng tự động
- Định nghĩa tương tác của các ràng buộc tôpô
- Khoảng cách theo cặp Robinson-Foulds
- Khả năng xảy ra trên mỗi trang web
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Tk
Ngôn ngữ lập trình
Python
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/raxmlgui/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
