这是命令 autodocktools，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
adt - AutoDockTools，AutoDock 的图形前端
概要
运行Adt [选项]
商品描述
本手册页几乎是对提供的输出的字面翻译 运行Adt -h
命令。
配置
下面是选项的摘要。 有关完整说明，请参阅
在线提供的教程和文档。
-H， - 帮帮我
显示选项摘要。
-a or - 再次
播放上次日志文件
--覆盖日志
覆盖日志文件
--uniqueLog
创建一个具有唯一名称的日志文件
--无日志
关闭日志
--没有飞溅
关闭启动画面
- 死 不启动 GUI 事件循环
--定制器 文件
运行用户指定的文件
--lib 包裹名字
添加命令库
-v r, - 想象 运行
在命令行上运行视觉网络
-v o, - 想象 一旦
运行视觉网络并退出 ADT
-d or --d模式 模式
指定显示模式
模式可以是显示模式的任意组合
'cpk'：cpk
'线'：线
'ss' : 二级结构带
'sb' : 棍子和球
'lic' : 甘草
'ms' : 分子表面
'ca' : C-alpha 跟踪
'bt' : 骨干跟踪
'sp'：CA样条
'sssb' : 蛋白质、棒和球的二级结构
其他有键的残基用于其他无键的残基
-c or --c模式 模式
指定显示模式配色方案：
'ca' : 按原子颜色
'cr' ：残基颜色（RASMOL 方案）
'cc' : 按链着色
'cm' : 按分子颜色
'cdg'：使用 David Goodsell 方案的颜色
'cs' : 使用 Shapely 方案的颜色残留
'css'：按二级结构元素着色
例：
将蛋白质显示为带状，非蛋白质显示为棒和球，并按原子类型显示颜色
adt -i --dmode sssb --cmode cr myprot.pdb
adt -i -m sssb -c cr myprot.pdb
使用 onworks.net 服务在线使用 autodocktools
