这是命令 autodock4，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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autodock - 化学配体与蛋白质受体的对接
概要
自动坞站4 [选项]
商品描述
AutoDock 执行化合物与蛋白质的自动对接，即它预测
小分子（如底物或候选药物）如何与已知 3D 的受体结合
结构。
AutoDockSuite 由两个主要程序组成，其中 AutoDock 执行对接
配体到一组描述目标蛋白质的网格和 AutoGrid 预先计算
这些网格。
配置
-p 参数文件名
-l 日志文件名
-o 使用旧的 PDBQ 格式，在第 55-61 列中收取 q
-k 保留原始残留数
-i 忽略标头检查
-t 解析 PDBQ 文件以检查扭转，然后停止。
-c < command_file 命令模式，按文件
-c | control_program 命令模式，由 control_program
例
在 Debian 上，目录 /usr/share/doc/autodock 提供了运行示例。 改成那个
目录并解压（以 root 身份）gzip 压缩的地图文件，然后执行 AutoDock，如图所示
下面：
枪压缩 *.map.gz
autodock4 -p 1pgp.dpf -l /tmp/1pgp.dlg
AutoDockTools 套件有助于解释结果。 还请检查
在线提供的教程。
使用 onworks.net 服务在线使用 autodock4
