这是 gmx-pme_error 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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gmx-pme_error - 估计在给定输入文件中使用 PME 的错误
概要
gmx pme_错误[-s [<.tpr>][-o [<.out>][-所以 [<.tpr>][-β ]
[-[没有]调[-自 [-种子 [-[没有]v]
商品描述
GMX pme_错误 如果使用 sPME 算法,估计静电力的误差。
旗 -调 将确定分裂参数,使得误差相等
分布在实空间部分和互易空间部分。 错误产生的部分
粒子的自相互作用在计算上要求很高。 然而,一个好的
近似是只使用粒子的一小部分来表示这个术语,它可以是
由旗帜指示 -自.
配置
指定输入文件的选项:
-s [<.tpr>] (白杨.tpr)
便携式 xdr 运行输入文件
指定输出文件的选项:
-o [<.out>] (错误输出)
通用输出文件
-所以 [<.tpr>] (调谐.tpr) (可选)
便携式 xdr 运行输入文件
其他选项:
-β (-1)
如果为正,则覆盖 ewald_beta .tpr 具有此值的文件
-[没有]调 (否)
调整分裂参数,使误差在
实空间和互易空间
-自 (1)
如果介于 0.0 和 1.0 之间,则仅根据该分数确定自交互误差
带电粒子
-种子 (0)
用于蒙特卡罗算法的随机数种子 -自 被设置为一个值
0.0 1.0和之间
-[没有]v (否)
大声喧哗
使用 onworks.net 服务在线使用 gmx-pme_error
