LAshow - 云端在线

程序：

您的姓名

LAshow - 显示来自 .las 文件的本地对齐

概要

洛杉矶秀 [-卡罗UF[-iINT(4)[-wINT(100)][-bINT(10)] src1:db|坝 [src2:db|坝] 对齐：激光
[读取：文件 | 阅读：范围 ...]

商品描述

洛杉矶秀 生成包含在指定 .las 中的本地对齐的打印列表
文件，a 和 b 读取来自 来源1 或 来源1 和 来源2， 分别。 如果一个
给出了读取范围的文件或列表，然后只有 a-read 所在的重叠
显示文件或列表指定的集合。 看 数据库显示(1) 解释
如何解释文件和读取范围列表。

配置

-F 反转显示中 a- 和 b- 读数的角色

-U 对 DNA 序列使用大写而不是默认的小写

-i缩进
如果需要，设置卡通和/或对齐显示的缩进。
（默认：4）

-bnum_symbols 个
设置对齐中对齐段两侧的符号数
展示。 （默认：10）

-ww 该参数用于指定的显示模式 -a 和 -r. （默认：
100）

-o 仅显示正确重叠的对齐方式——即序列结束的位置
发生在对齐的每一端

显示屏玻璃制造 模式
-c 对齐的卡通渲染

-一种， -r 显示局部路线的路线

-a 选项完全正确 w 每段显示的列，而 -r 选项
准确地放 w 显示每个段中的读取符号。 这 -r 显示模式是
当人们想要直观地比较涉及相同 a-read 的两个对齐时很有用。 如果一个
的组合 -c, -a及 -r 设置标志，然后卡通出现，然后 -a
对齐，最后 -r 对准。

使用 onworks.net 服务在线使用 LAshow