这是名为 EigenMS 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可作为 EigenMS.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 EigenMS 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
EigenMS 在 Linux 上在线运行
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商品描述
EigenMS 是一种在 R（以及 Matlab 中的旧版本）中实现的归一化方法，可作为一组应在序列中使用的两个函数。请下载 EigenMS.zip 文件（最新版本）。
2017 年 XNUMX 月上传的最新版本修复了单个处理组标准化的错误。
从 2015 年开始省略了重新缩放。
EigenMS 利用 SVD 检测数据中的偏差趋势并消除它们。 EigenMS 消除了已知和未知因素的影响，可用于任何组学平台。
我们在以下两篇论文中展示了它在 LC-MS/MS 和代谢组学中的实用性：
1) PMID：19602524。“使用奇异值分解对自底向上的基于 MS 的蛋白质组学中的峰值强度进行归一化”。
Karpievitch YV、Taverner T、Adkins JN、Callister SJ、Anderson GA、Smith RD、Dabney AR。
生物信息学 2009
2) “使用 EigenMS 进行代谢组学数据标准化”
Karpievitch YV、Nikolic SB、Wilson R、Sharman JE、Edwards LM。
公共科学图书馆一号 2014
目的
学术/科研
程式语言
MATLAB，S/R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/eigenms/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
