这是名为 Calis-p 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可作为 calis-p-0.1.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 Calis-p 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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calis -p 在 Linux 上在线运行
商品描述
Calis-p（蛋白质组学中同位素的 CALgary 方法）是一个软件包，用于从宏蛋白质组数据集中直接提取微生物群落中单个物种的稳定碳同位素指纹 (SIF)。 它将样品和校准材料的评分肽谱匹配 (PSM) 表，以及 mzML 格式的原始 MS 数据作为输入。 在第一步中，软件会找到每个 PSM 的同位素峰，并将它们在指定保留时间窗口内的强度相加。 报告确定的同位素模式（m/z 值对 + 总强度）以及确定的肽的总和公式，并用作 Calis-p 的第二步的输入，以计算通过一组的所有肽的 delta13C 值过滤器的数量，以及每个物种的平均 delta13C 值和标准误差。 物种 delta13C 值需要通过应用使用参考材料确定的偏移量来校正仪器同位素分馏。特性
- SIF 数据直接从标准的元蛋白质组数据集中提取
- 以高通量方式高效可靠地获取微生物群落样本中大量物种的 SIF 值。
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/calis-p/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
