这是一个名为 Protein Contact Matrix Generator 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 PCMGen1.0_executable.jar。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Protein Contact Matrix Generator 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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蛋白质接触矩阵生成器
商品描述
蛋白质接触矩阵是 2D 蛋白质结构中氨基酸残基之间距离的 3D 表示。 蛋白质接触图生成器 (PCMGen) 是一个命令行工具，它以蛋白质 3D 结构（PDB 格式文件）作为输入并计算两条链之间的接触距离（来自单个或两个不同的蛋白质）。 这些矩阵文件可以使用其他可视化工具/程序（如 R-heatmaps）进一步可视化为联系人地图。
接触图可用于了解蛋白质'：
1. 二级结构
2.构象安排
3. 表面相互作用
功能
- 结构信息学
- 蛋白质接触图
- 基于 Java 的 CLI 应用程序
目的
最终用户/桌面
用户界面
命令行
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/proteincontactmap/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
