这是名为simulate_pcr 的Linux 应用程序，其最新版本可以下载为simulate_PCR-v1.2.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为simulate_pcr 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
模拟pcr
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商品描述
评估引物特异性并预测所需和脱靶的扩增产物是稳健 PCR 检测设计的必要步骤。 该脚本预测大型序列数据库（如 NCBI nt）中潜在的聚合酶链反应 (PCR) 扩增子来自单链或大型多路引物组，允许简并引物和探针碱基，目标错配耐受性和扩增子长度范围可通过以下方式设置用户。 PCR 扩增子模拟代码还使用从 NCBI 自动下载的基因信息对扩增子进行注释，并且可选地它可以预测预测的扩增子中是否还有 TaqMan/Luminex 探针匹配。 它是一个名为simulate_PCR.pl 的开源命令行Perl 脚本，它调用BLAST（Altschul 等人，1990 年）程序makeblastdb、blastn 和blastdbcmd，以及NCBI efetch 实用程序（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi).这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/simulatepcr/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
