这是名为 SW# 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 swsharp-src.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 SW# 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
软件#
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商品描述
SW# (swsharp) 是一个基于启用 CUDA 的 GPU 的序列比对库。 它利用 Hirschbergs 和 Ukkonens 算法来提高内存效率和额外的加速。 该库可扩展以用于多个 GPU。 库的某些部分将 MPI 用于启用 CUDA 的集群。这项工作得到了克罗地亚科学基金会项目 UIP-11-2013-7353 的部分支持。
数据库搜索现已可用!
出版物:
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145857
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2494
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/23/nar.gkt1164.abstract#!
相关工作:
http://exolocator.bii.a-star.edu.sg/
新:
SW# 网络版:
http://swsharp.zesoi.fer.hr/
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/swsharp/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
