适用于 Linux 的 ADOMA 下载

这是一个名为 ADOMA 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 adoma-1.0.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

 
 

使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 ADOMA 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

截图:


阿多玛


描述:

ADOMA 代表:多重对齐的替代显示。 ADOMA 可以创建四种不同的多序列比对显示:HTML 格式的 ClustalW 比对、HTML 和/或 txt 格式的简化 ClustalW 比对和 HTML 格式的彩色 ClustalW 比对。 有关这些输出文件的示例,请查看屏幕截图。 ADOMA 使用 ClustalW 从 DNA 或蛋白质序列创建多重比对,并显示它们与 ClustalW 的正常输出略有不同。 ADOMA 是一个命令行程序,可以很容易地在管道中使用。

有关更多信息,请查看文件部分中的 README.md。

如何引用 ADOMA:

Zaal, D. 和 Nota, B. (2016),ADOMA:修改 ClustalW 多重对齐输出的命令行工具。 摩尔。 参考资料,35:42-44。 doi:10.1002/minf.201500083

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract




用户界面

命令行


程式语言

Unix 外壳,Python


分类目录

生物信息学,可视化

这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/adoma/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。



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