هذا هو الأمر arden-analyze الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
تحليل أردن - تحليل نتائج رسم خرائط الجينوم المرجعي الاصطناعي
موجز
تحليل أردن [الخيارات] [INPUT FILE] [مجلد الإخراج] ...
الوصف
البرنامج النصي لتحليل نتائج رسم خرائط الجينوم المرجعي الاصطناعي. هذا البرنامج النصي
يحدد TPs / FPs المفترضة في مجموعة بيانات محددة (يقرأ).
OPTIONS
مجلد الإخراج
المسار إلى مجلد وجهة الإخراج.
INPUT FILE
ppath إلى ملف ini. للحصول على التنسيق المطلوب، قم بإلقاء نظرة على ملفات الأمثلة.
--الإصدار
إظهار رقم إصدار البرنامج والخروج
-h, --مساعدة
إظهار رسالة المساعدة هذه والخروج
-p فريد، --phred=فريد
حدد ترميز PHRED لقراءات الإدخال، أي Illumina 1.3+ = -p 33.[افتراضي:
33]
-r رتبة، --internalrank=RANK
استخدم الترتيب الداخلي للقراءات (مطلوب إذا كانت أسماء القراءة لا يمكن أن تكون كذلك
يتم فرزها معجميًا بنفس الطريقة في python ونظام التشغيل الخاص بك بواسطة sam
الأدوات).[الافتراضي:1]
استخدم تحليل arden عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net