Mincstats - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

mincstats - حساب إحصائيات بسيطة عبر وحدات البكسل لملف minc

موجز

com.mincstats [ ] .mnc

الوصف

مينكستات سيحسب مقاييس إحصائية بسيطة عبر جميع وحدات البكسل لملف minc.
لاحظ أن هذه مقاييس إحصائية عالمية وليست مقاييس فوكسل بفوكسل (انظر
com.mincaverage من أجل هذا). افتراضيا يتم حساب جميع الإحصائيات. إذا كانت أي إحصاءات
طلب عبر خيار سطر الأوامر ، ثم تتم طباعة الإحصائيات المطلوبة فقط.

من الميزات المفيدة جدًا لهذا البرنامج القدرة على تقييد مجموعة وحدات البكسل
المدرجة في الحساب الإحصائي ، إما عن طريق تقييد نطاق القيم المضمنة ،
أو باستخدام ملف قناع بنطاق مقيد. نطاقات متعددة لملف الإدخال أو
يمكن تحديد ملف القناع. لكل نطاق من قيم الحجم المضمنة ولكل نطاق
من قيم القناع ، يتم طباعة الإحصائيات ذات الصلة (قيم n * m ، حيث n هو الرقم
من نطاقات الحجم و m عدد نطاقات القناع). تتم هذه الحسابات في واحد
تمر عبر البيانات ، لذا فإن تحديد نطاقات متعددة أسرع بكثير من تشغيل
البرنامج بشكل متكرر. هذا مفيد جدًا عند حساب العديد من المتوسطات الإقليمية باستخدام ملف
حجم قناع VOI.

يجب التنويه بشكل خاص إلى الرسوم البيانية والتدابير الإحصائية ذات الصلة. ال
النطاق الافتراضي للرسم البياني هو من أصغر قيمة في الملف إلى أكبرها. في
الحالة ليست غير شائعة ، ولكنها خاصة ، عندما يتطابق عدد صناديق المدرج التكراري تمامًا مع
عدد القيم الممكنة في الملف (على سبيل المثال 256 حاوية لبيانات البايت كاملة النطاق) ، فإن ملف
يمكن أن ينتهي الرسم البياني ببعض الميزات الفردية عند استخدام نطاق الرسم البياني الافتراضي. هذا
ينشأ من تقدير البيانات التي يتم إعادة إدخالها بعد ذلك إلى ملف
الهستغرام غير متطابق. بالنسبة لمثال بيانات البايت ، فإن القيم التي يجب استخدامها هي 256
الصناديق ونطاق الرسم البياني الذي يمتد بمقدار نصف حاوية أقل من أصغر قيمة ونصف حاوية
فوق الأكبر. استخدم الخيار - مخطط تفصيلي للعمل بها تلقائيًا ، أو استخدامها
عدد صحيح للحصول على خانات بعرض الوحدة إذا كانت بيانات الإدخال عددًا صحيحًا بطبيعتها
(مثل بيانات التسمية). بشكل عام ، يجب على المرء أن يكون حذرًا بشأن rebinning من تقديري
البيانات إلى مدرج تكراري بحجم حاوية قريب من مستوى التمييز.

OPTIONS

لاحظ أنه يمكن تحديد الخيارات بصيغة مختصرة (طالما أنها فريدة) و
يمكن إعطاؤها في أي مكان على سطر الأوامر. ترتيب طباعة الإحصائيات
ستكون دائمًا هي نفسها بغض النظر عن الترتيب الذي تم طلبها به في
سطر الأوامر

العلاجات العامة الخيارات

-ضرب بقسوة
الكتابة فوق ملف موجود.

-نوكلوبر
لا تكتب فوق ملف موجود (افتراضي).

-إفراط
اطبع معلومات إضافية (أكثر من الافتراضي).

-هادئ اطبع فقط الأرقام المطلوبة

-الحد الأقصى_المخزن_الحجم_في_ك.بي. المقاسات
حدد الحجم الأقصى للمخازن المؤقتة الداخلية (بالكيلو بايت). الافتراضي هو 4 ميغا بايت.

باطل قيمنا الخيارات

-ignore_nan
استبعاد القيم غير الصالحة (خارج النطاق الصالح) من الحسابات الإحصائية. هذا هو
الافتراضي.

-تضمين_نان
تعامل مع القيم غير الصالحة كأصفار وقم بتضمينها في الحسابات الإحصائية.

-replace_nan قيمنا
استبدل القيم غير الصالحة بالقيمة المحددة وقم بتضمين القيمة الجديدة في
حسابات إحصائية.

الصوت نطاق الخيارات

-أرضية min1,min2، ...
قائمة مفصولة بفواصل للحدود السفلية لنطاقات البيانات المراد تضمينها في الإحصاء
عملية حسابية.

-سقف max1,max2، ...
قائمة مفصولة بفواصل للحدود العليا لنطاقات البيانات المراد تضمينها في الإحصاء
عملية حسابية.

-نطاق min1,max1,min2,max2، ...
قائمة مفصولة بفواصل للحدود الدنيا والعليا لنطاقات البيانات المراد تضمينها
حساب إحصائي.

- قيمة val1,val2، ...
قائمة مفصولة بفواصل لقيم الأعداد الصحيحة لتضمينها في الحساب الإحصائي. نطاق
من +/- 0.5 يتم تحديدها حول كل قيمة محددة.

-قناع اسم الملف
اسم الملف الذي سيتم استخدامه لإخفاء البيانات المضمنة في الحساب الإحصائي. ل
للحصول على أي تأثير ، يجب تحديد نطاق قناع بأحد الخيارات التالية
خيارات.

-قناع_الطابق min1,min2، ...:
اعجاب -أرضية، ولكن يتم تطبيقها على ملف القناع.

-قناع max1,max2، ...
اعجاب -سقف، ولكن يتم تطبيقها على ملف القناع.

-قناع_رانج min1,max1,min2,max2، ...
اعجاب -نطاق، ولكن يتم تطبيقها على ملف القناع.

-قناع val1,val2، ...
اعجاب - قيمة، ولكن يتم تطبيقها على ملف القناع.

الرسم البياني الخيارات

- الرسم البياني اسم الملف
حدد اسم الملف الذي تمت كتابة الرسم البياني فيه. إذا نطاقات متعددة
أو يتم تحديد نطاقات القناع ، ثم تتم كتابة جميع الرسوم البيانية في هذا الملف ،
مفصولة بأسطر فارغة. المعلومات التي تصف كل مدرج تكراري مكتوبة من قبل
في سطور تبدأ بحرف التجزئة (الجنيه). يمكن تحميل هذه الملفات
في gnuplot.

-صناديق عدد الصناديق
حدد عدد الحاويات في الرسم البياني.

-صناديق عدد الصناديق
مرادف ل -صناديق.

-الخلفية دقيقة
حدد الحد الأدنى للرسم البياني.

-خست_صورة ماكس
حدد الحد الأعلى للرسم البياني.

-النطاق_المختصر دقيقة ماكس
حدد نطاقًا للرسم البياني

عدد صحيح
قم بإنشاء صناديق لعرض الوحدة ، تتمحور حول قيم الأعداد الصحيحة. هذا مفيد ل
بيانات عدد صحيح مثل التسميات. يتم تقريب نطاق المدرج التكراري إلى أقرب عدد صحيح ،
ثم يتم خفض الحد الأدنى ورفع الحد الأقصى بمقدار 0.5. عدد الصناديق مأخوذ
كالفرق بين هاتين القيمتين. لاحظ أنه تمت إضافة 0.01 إلى الحد الأدنى و
مطروحًا من الحد الأقصى قبل التقريب للتأكد من أن أ
يتم الحفاظ على النطاق المحدد بشكل صحيح (على سبيل المثال [0.5,255.5،XNUMX]). إذا كنت تريد أن يكون لديك
صناديق الأعداد الصحيحة التي تكون أعرض من واحد ، سيكون عليك حساب نطاق الرسم البياني
وعدد الصناديق بنفسك وعدم استخدام هذا الخيار.

- مخطط تفصيلي
محاولة مطابقة المدرج التكراري لتقدير بيانات الإدخال. هذا هو
مناسبة للبيانات المستمرة التي يتم تخزينها في تمثيل عدد صحيح و
عندما يكون عرض الحاوية قريبًا من التقدير المطلوب. هذا مشابه ل
عدد صحيح، فيما عدا أن نطاق الرسم البياني يتم تحويله أولاً إلى voxel
القيم التي يتم تقريبها وتوسيعها بمقدار نصف حاوية على كلا الجانبين. هذا فوكسل الجديد
يتم تحويل النطاق مرة أخرى إلى القيم الحقيقية. يتم أخذ عدد الصناديق على أنه
الاختلاف في نطاق قيمة فوكسل. لاحظ أن هذا لا يأخذ في الحسبان الاختلافات
في القياس من شريحة إلى شريحة ، لذلك قد يستمر حدوث تأثيرات مدرج تكراري غريبة. هذا الخيار هو
تهدف إلى إعطاء سلوك مشابه لسلوك الحجم_الحسابات.

-int_max_bins عدد الصناديق
حدد أكبر مدرج تكراري يمكن تغيير حجمه تلقائيًا باستخدام ما ورد أعلاه
خيارات. يمنع الحد الإنشاء العرضي لمدرج تكراري ضخم. هذا الخيار
استبدال القديم -الحد الأقصى للصناديق الخيار في MINC 1.1.

الباقة الأساسية إحصائيات

-كل حساب جميع المقاييس الإحصائية. هذا هو الافتراضي.

-لا توجد مرادف ل -العد (للتشابه مع volume_stats). لاحظ أنه على الرغم من أن هذا كان
ضروري ل الحجم_الحسابات، ليس هناك حاجة هنا ، منذ تحديد أي من هؤلاء
الخيارات تنطفئ تلقائيا -كل

-العد عد عدد وحدات البكسل الموجودة داخل النطاق والقناع.

-نسبه مئويه
اطبع النسبة المئوية من وحدات البكسل ضمن النطاق والقناع

-الصوت
قم بطباعة حجم وحدات البكسل داخل النطاق والقناع (بالملم مكعب).

-دقائق اطبع القيمة الدنيا.

-الأعلى اطبع القيمة القصوى.

-مجموع اطبع مجموع كل القيم.

-جمع 2 اطبع مجموع مربعات كل القيم.

-يقصد اطبع المتوسط.

-التباين
اطبع التباين.

-الأمراض المنقولة جنسيا ديف
اطبع الانحراف المعياري.

-انحراف
اطبع انحراف العينة (اللحظة الثالثة).

-كورتيز
اطبع عينة التفرطح (اللحظة الرابعة).

-CoM اطبع مركز الكتلة. كل من إحداثيات فوكسل وإحداثيات العالم هي
طبع. تُطبع إحداثيات فوكسل بترتيب ملف ، بينما تتم طباعة إحداثيات فوكسل في جميع أنحاء العالم
تتم طباعة الإحداثيات بترتيب x و y و z.

-كوم مرادف ل -CoM.

-العالم_فقط
اطبع مركز الكتلة في إحداثيات العالم فقط.

الرسم البياني إحصائيات

لاحظ أن إحصائيات الرسم البياني مشتقة فقط من تعداد المدرج التكراري والحاوية
المراكز ، لذا فإن النتائج مثل الوسيط لن تكون مطابقة تمامًا للقيمة الحقيقية لـ
وشملت جميع وحدات فوكسل. على سبيل المثال ، يمكن أن يصل الخطأ في الوسيط إلى نصف حاوية
عرض. علاوة على ذلك ، إذا كان نطاق المدرج التكراري أقل من نطاق وحدات البكسل المضمنة ، فعندئذٍ
تنطبق النتيجة فقط على وحدات البكسل المضمنة في الرسم البياني.

-hist_count
طباعة عدد وحدات البكسل في الرسم البياني. قد يكون هذا مختلفًا عن عدد
وحدات البكسل المضمنة والمُقنعة إذا كان نطاق الرسم البياني أقل من نطاق
البيانات المضمنة.

- نسبة_مؤخرة
نسبة طباعة وحدات البكسل المضمنة في الرسم البياني.

-الوسيط
اطبع وسيط المدرج التكراري.

-غالبية
اطبع مركز الحاوية (قيمة الكثافة) للحاوية التي تحتوي على أكبر عدد من التهم.

-biModalT
اطبع عتبة ثنائية الوسائط بفصل وحدة التخزين إلى فئتين. الافتراضي هو
لاستخدام طريقة otsu (انظر الخيارات أدناه)

-وتسو استخدم الطريقة الموضحة في Otsu N ، "طريقة تحديد العتبة من المستوى الرمادي
الرسوم البيانية "، IEEE Trans on Systems، Man and Cybernetics. 1979، 9: 1؛ 62-66 to
احسب العتبة

-كيتلر
استخدم خوارزمية Kittler & Illingworth '86 لحساب عتبة ثنائية النسق.
Kittler، J. & Illingworth J.، "Minimum error thresholding"، Pattern Recognition،
المجلد 19 ، الصفحات 41-47 ، 1986.

-كابور استخدم كابور وآخرون. خوارزمية 85 لحساب العتبة ثنائية النسق. كابور ،
Sahoo & Wong "طريقة جديدة لعتبة الصورة ذات المستوى الرمادي باستخدام إنتروبيا
الرسم البياني "، رؤية الكمبيوتر والرسومات ومعالجة الصور ، المجلد 29 ، ص
273-285، 1985.

-بسيط
استخدم خوارزمية متوسط ​​الوسيلة البسيطة لحساب عتبة ثنائية النسق. هذا أكثر
باهظة التكلفة من الناحية الحسابية من بعض البدائل ، ولا يبدو أنها تفعل ذلك
عمل عظيم. لكنها تبدو أكثر قوة من بعض الطرق الأخرى.

-بكت اطبع العتبة المطلوبة لنسبة حرجة معينة من المدرج التكراري.

-إنتروبيا
اطبع إنتروبيا شانون.

H (x) = - Sum (P (i) * log2 (P (i))

حيث P (i) هو احتمال bin

عام الخيارات For من جميع أوامر:

-مساعدة اطبع ملخصًا لخيارات سطر الأوامر واخرج.

-الإصدار
اطبع رقم إصدار البرنامج واخرج.

استخدم mincstats عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net