هذا هو تطبيق Windows المسمى LoopMatcher والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـloopmatcher1.3.3.rar. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى LoopMatcher مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل أي محاكي لنظام التشغيل OnWorks عبر الإنترنت من موقع الويب هذا ، ولكن أفضل محاكي Windows عبر الإنترنت.
- 5. من نظام التشغيل OnWorks Windows الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته.
- 7. قم بتنزيل Wine من مستودعات برامج توزيعات Linux الخاصة بك. بمجرد التثبيت ، يمكنك النقر نقرًا مزدوجًا فوق التطبيق لتشغيله باستخدام Wine. يمكنك أيضًا تجربة PlayOnLinux ، وهي واجهة رائعة على Wine والتي ستساعدك على تثبيت برامج وألعاب Windows الشائعة.
يعد Wine طريقة لتشغيل برامج Windows على نظام Linux ، ولكن بدون الحاجة إلى Windows. Wine عبارة عن طبقة توافق Windows مفتوحة المصدر يمكنها تشغيل برامج Windows مباشرة على أي سطح مكتب Linux. بشكل أساسي ، يحاول Wine إعادة تنفيذ ما يكفي من Windows من البداية حتى يتمكن من تشغيل جميع تطبيقات Windows دون الحاجة إلى Windows بالفعل.
لقطات الشاشة:
LoopMatcher
الوصف:
LoopMatcher هي أداة معلوماتية حيوية تبحث عن هياكل دبوس الشعر في تسلسلات cDNA / mRNA (بتنسيق FASTA أو GenBank أو Vienna) مع تسلسلات إجماع محددة في الحلقة. ويستخدم RNAfold للتنبؤ ببنية التسلسل وUShuffle لإنشاء تسلسلات عشوائية بتردد محدد للنيوكليوتيدات. أيضًا، يمكن تنزيل التسلسلات بتنسيق GenBank مباشرة من NCBI باستخدام معرف وصول NCBI.
المتطلبات الأساسية
JAVA Runtime 8. يوصى بشدة أن يكون لديك معالج متعدد النواة لمعالجة التسلسلات الكبيرة.
* حاليًا، يعمل هذا الإصدار فقط على نظام التشغيل Windows x64.
المميزات
- دعم ملفات تنسيق GenBank وFASTA وVienna
- معالجة ملف واحد أو عدة ملفات
- الحصول على التسلسلات ومعالجتها من NCBI
- ابحث عن أنماط متعددة باستخدام كود FASTA IUPAC للنيوكليوتيدات
- إنشاء إصدارات عشوائية باستخدام معلمة k-let (خوارزمية Ushuffle)
- النتائج في جدول بتنسيق CSV
- وضعان للطي، موضعي أو عالمي (تسلسل كامل)
- الطي باستخدام RNAFold (الحد الأدنى من بنية الطاقة الحرة)
الجمهور
العلوم / البحث والتعليم
واجهة المستخدم
تأرجح جافا
لغة البرمجة
جافا
بيئة قاعدة البيانات
ملف ثابت
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/find-a-loop/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.