এই কমান্ড ডেন যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
dan - নিউক্লিক অ্যাসিড গলানোর তাপমাত্রা গণনা করে
সাইনোপিসিস
দেনিযেল -ক্রম seqall - উইন্ডোর আকার পূর্ণসংখ্যা - শিফট ইনক্রিমেন্ট পূর্ণসংখ্যা -dnaconc ভাসা
-লবণ ভাসা [- পণ্য টগ্ল] -ফরমামাইড ভাসা -অমিল ভাসা -prodlen পূর্ণসংখ্যা
[-থার্মো টগ্ল] -টেম্পেরেশন ভাসা -আরএনএ বুলিয়ান -পটভূমি টগ্ল -মিনটেম্প ভাসা
-চিত্রলেখ xygraph -আউটফাইল রিপোর্ট
দেনিযেল -হেল্প
বর্ণনাঃ
দেনিযেল এটি EMBOSS ("ইউরোপীয় মলিকুলার বায়োলজি ওপেন সফটওয়্যার) থেকে একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম
সুইট"). এটি "নিউক্লিক: প্রোপার্টিজ, নিউক্লিক: কম্পোজিশন" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।
বিকল্প
ইনপুট অধ্যায়
-ক্রম seqall
প্রয়োজনীয় অধ্যায়
- উইন্ডোর আকার পূর্ণসংখ্যা
গলনাঙ্কের মান এবং অনুক্রমের অন্যান্য থার্মোডাইনামিক বৈশিষ্ট্যগুলি হল
একটি উইন্ডো হিসাবে পরিচিত অনুক্রমের একটি সংক্ষিপ্ত দৈর্ঘ্য গ্রহণ করে এবং নির্ধারণ করে
সেই উইন্ডোতে অনুক্রমের বৈশিষ্ট্য। জানালা ক্রমবর্ধমান বরাবর সরানো হয়
প্রতিটি নতুন অবস্থানে গণনা করা বৈশিষ্ট্য সহ ক্রম। ডিফল্ট মান: 20
- শিফট ইনক্রিমেন্ট পূর্ণসংখ্যা
এটি সেই পরিমাণ যার দ্বারা প্রতিটি ইনক্রিমেন্টে উইন্ডোটি সরানো হয় যাতে এটি খুঁজে পাওয়া যায়
গলনাঙ্ক এবং ক্রম বরাবর অন্যান্য বৈশিষ্ট্য. ডিফল্ট মান: 1
-dnaconc ভাসা
ডিফল্ট মান: 50.
-লবণ ভাসা
ডিফল্ট মান: 50.
অতিরিক্ত অধ্যায়
পণ্য অপশন
- পণ্য টগ্ল
এটি শতাংশ ফরমামাইড, অনুমোদিত অমিলের শতাংশ এবং পণ্যের দৈর্ঘ্যের জন্য অনুরোধ করে।
-ফরমামাইড ভাসা
এটি গণনায় ব্যবহৃত শতাংশ ফর্মামাইড নির্দিষ্ট করে (যদি না এটি উপেক্ষা করা হয়
- পণ্য ব্যবহার করা হয়)। ডিফল্ট মান: 0।
-অমিল ভাসা
এটি গণনায় ব্যবহার করা শতাংশের অমিল উল্লেখ করে (এটি উপেক্ষা করা হয় যদি না
- পণ্য ব্যবহার করা হয়)। ডিফল্ট মান: 0।
-prodlen পূর্ণসংখ্যা
এটি গণনায় ব্যবহার করা পণ্যের দৈর্ঘ্য নির্দিষ্ট করে (যদি না এটি উপেক্ষা করা হয়
- পণ্য ব্যবহার করা হয়)। ডিফল্ট মান: $(windowsize)
thermodynamic অপশন
-থার্মো টগ্ল
আউটপুট ডেটাতে সিকোয়েন্স উইন্ডোর DeltaG, DeltaH এবং DeltaS মানগুলি আউটপুট করুন
ফাইল.
-টেম্পেরেশন ভাসা
যদি -থার্মো নির্দিষ্ট করা থাকে তবে এটি কোন তাপমাত্রায় তা নির্দিষ্ট করে
DeltaG, DeltaH এবং DeltaS মান গণনা করুন। ডিফল্ট মান: 25।
অগ্রসর অধ্যায়
-আরএনএ বুলিয়ান
এটি নির্দিষ্ট করে যে ক্রমটি একটি RNA ক্রম এবং একটি DNA ক্রম নয়।
আউটপুট অধ্যায়
-পটভূমি টগ্ল
যদি এটি নির্দিষ্ট করা না থাকে তবে আউটপুট ডেটার ফাইল তৈরি করা হয়, অন্যথায় এর একটি প্লট
ক্রম বরাবর গলনাঙ্ক উত্পাদিত হয়.
-মিনটেম্প ভাসা
প্লটের তাপমাত্রা স্কেল (y-অক্ষ) এর জন্য একটি সর্বনিম্ন মান লিখুন। ডিফল্ট মান:
55.
-চিত্রলেখ xygraph
-আউটফাইল রিপোর্ট
যদি একটি প্লট তৈরি করা না হয় তবে প্রতিটি উইন্ডোতে গলনাঙ্ক ইত্যাদির ডেটা
ক্রম বরাবর ফাইল আউটপুট হয়.
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে ডেন অনলাইন ব্যবহার করুন