Dies ist der Befehl dbgeturle, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
dbgeturl – Ruft Links zu Datenbankeinträgen für eine benannte Datenbank, einen Datentyp und Daten ab
Kennzeichnung
ZUSAMMENFASSUNG
dbgeturl -Datenbank Schnur -Datentyp Schnur -Kennung Schnur [-outfile Outfile]
dbgeturl -Hilfe
BESCHREIBUNG
dbgeturl ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Utils:Misc".
OPTIONAL
zufuhr Abschnitt
-Datenbank Schnur
Dies ist der Name einer Datenbank aus dem Katalog der öffentlichen Datenbanken im EMBOSS
Datendatei DRCAT.dat. Wenn Sie sich über die verfügbaren Datenbanken nicht sicher sind, verwenden Sie dbfind. Wenn du
Wenn Sie einen Datenbanknamen haben, aber nicht sicher sind, ob er gültig ist, verwenden Sie isdbname.
-Datentyp Schnur
Dies ist der Name eines abrufbaren Datentyps aus dem Katalog öffentlicher Datenbanken in
die EMBOSS-Datendatei DRCAT.dat. Die Namen sind Begriffe aus dem „Daten“-Zweig des EDAM
Ontologie, http://edamontology.sourceforge.net/. Wenn Sie sich über die Verfügbarkeit nicht sicher sind
Um die abrufbaren Datentypen für eine bestimmte Datenbank zu ermitteln, verwenden Sie dbtellquery. Wenn Sie einen Datentyp haben
Name, sind aber nicht sicher, ob er gültig ist, verwenden Sie isdbdata.
-Kennung Schnur
Dabei handelt es sich um eine Datenkennung (z. B. eine Sequenzzugangsnummer), die zur Angabe verwendet wird
die abzurufenden Daten (vom Typ „Datentyp“). Wenn Sie sich über die Datenkennung(en) nicht sicher sind
die für eine bestimmte Abfrage (Datenbank/Datentyp) verwendet werden, verwenden dbtellquery. Die Arten von Daten
Identifikatoren sind im Zweig „Datenidentifikatoren“ der EDAM-Ontologie aufgeführt
(http://edamontology.sourceforge.net/). Beispielwerte finden Sie im Katalog von
öffentliche Datenbanken in der EMBOSS-Datendatei DRCAT.dat. Wenn Sie eine Datenkennung haben, aber
Wenn Sie sich über den Typ nicht sicher sind, verwenden Sie idtell.
Erforderlich Abschnitt
Zusätzliche Abschnitt
Fortgeschrittener Abschnitt
Output Abschnitt
-outfile Outfile
Standardwert: stdout
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