Dies ist der Befehl dotmatchere, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
dotmatcher - Zeichne ein Schwellenwert-Punktdiagramm von zwei Sequenzen
ZUSAMMENFASSUNG
Dotmatcher -eine Sequenz Reihenfolge -bfolge Reihenfolge [-Matrixdatei Matrix]
[-Fenstergröße ganze Zahl] [-Schwelle ganze Zahl] -strecken Umschalten -Graph Graph
-xygraph Xygraph
Dotmatcher -Hilfe
BESCHREIBUNG
Dotmatcher ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Ausrichtung:Punktdiagramme".
OPTIONAL
Eingang Abschnitt
-eine Sequenz Reihenfolge
-bfolge Reihenfolge
-Matrixdatei Matrix
Dies ist die Bewertungsmatrixdatei, die beim Vergleichen von Sequenzen verwendet wird. Standardmäßig ist es der
Datei 'EBLOSUM62' (für Proteine) oder die Datei 'EDNAFULL' (für Nukleinsequenzen). Diese
Dateien befinden sich im Verzeichnis 'data' der EMBOSS-Installation.
Zusätzliche Abschnitt
-Fenstergröße ganze Zahl
Standardwert: 10
-Schwelle ganze Zahl
Standardwert: 23
Ausgang Abschnitt
-strecken Umschalten
Anzeige einer nicht-proportionalen Grafik Standardwert: N
-Graph Graph
-xygraph Xygraph
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