Dies ist der Befehl xtractore, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
xtractore – Extrahieren Sie Sequenzen, die annotierten Merkmalen entsprechen, aus der angegebenen Sequenz
Datei
ZUSAMMENFASSUNG
xtractore [Optionen] Features.gff3 Sequenzen.fasta
BESCHREIBUNG
Zubehör:
-d|--debug
Debugging-Ausgabe drucken
-h|--hilfe
Drucken Sie diese Hilfenachricht und beenden Sie das Programm
-i|--idfile: DATEI
Datei mit einer Liste von Feature-IDs (1 pro Zeile ohne Leerzeichen); falls vorgesehen,
Es werden nur Features mit IDs in dieser Datei extrahiert
-o|--outfile: DATEI
Datei, in die Ausgabesequenzen geschrieben werden; Standard ist Terminal (stdout)
-t|--type: STRING
Zu extrahierender Feature-Typ; kann mehrfach verwendet werden, um Merkmale mehrerer zu extrahieren
Typen
-v|--Version
Versionsnummer drucken und beenden
-V|--verbose
ausführliche Warn- und Fehlermeldungen ausgeben
-w|--width: INT
Breite jeder Sequenzzeile in der Fasta-Ausgabe; Standardwert ist 80; für Nr. auf 0 setzen
Formatierung
Nutzen Sie xtractore online über die Dienste von onworks.net
