Dies ist die Linux-App mit dem Namen PARSEC - PAtteRn SEarch / Context, deren neueste Version als PARSEC_Deployment_Package_v2.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens PARSEC – PatterN SEarch / Context mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS:
PARSEC – MUSTERSUCHE/Kontext
BESCHREIBUNG:
Die Charakterisierung genomischer Stellen ist eine große Herausforderung für das Verständnis und die Nutzung von Sequenzierungsdaten der nächsten Generation. Die meisten genomischen Stellen werden durch kurze, degenerierte Motive mit verstreuter Verteilung und manchmal mit biologischer Funktion (z. B. Regulierung der Genexpression, Spleißmuster oder epigenetischen Signalen) dargestellt. Diese Motive sind mit einem enormen Rauschen verbunden und daher erfordert die Entwicklung einer Computerplattform zur genauen Erkennung genomischer Standorte die Integration verschiedener umfangreicher biologischer Daten, um falsch positive Ergebnisse herauszufiltern.
PARSEC stellt eine intuitive, modulare (leicht erweiterbare) Komplettlösung für die effiziente Integration vieler unterschiedlicher Genominformationen dar, um eine nichtlineare Lokalisierung und Charakterisierung biologischer Standorte in einer benutzerfreundlichen Umgebung durchzuführen.
Informationen zu Hardwareanforderungen und unterstützten Browsern finden Sie im Wiki.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Webbasierte
Programmiersprache
C++, Java
Datenbankumgebung
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
Berufsfeld
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.