Este es el comando diff_tomo que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
diff_tomo - construcción de sinograma de tomografía de difracción
DESCRIPCIÓN
uso: diff_tomo [opciones] -p archivos de imagen ponifile * Si el número de archivos es demasiado grande,
use comillas dobles como "* .edf"
Integración azimutal para tomografía de difracción. La tomografía por difracción es un experimento.
donde los patrones de difracción 2D se registran mientras se realiza un escaneo 2D, uno (el más lento)
en rotación alrededor del centro de la muestra y el otro (el más rápido) a lo largo de una traslación
a través de la muestra. Diff_tomo es un script (basado en pyFAI y h5py) que permite la
reducción de este conjunto de datos 4D en un conjunto de datos 3D que contiene el ángulo de rotación (cientos),
el paso de traslación (cientos) y los muchos ángulos de difracción (miles). La resultante
El conjunto de datos se puede abrir usando PyMca roitool donde el conjunto de datos 1d debe seleccionarse como último
dimensión. Este archivo no es (todavía) compatible con NeXus. Esta herramienta se puede utilizar para mapear
experimentos si se considera la dirección de exploración lenta como la rotación.
posicional argumentos:
ARCHIVO Lista de archivos para calibrar
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-V, --versión
mostrar el número de versión del programa y salir
-o EXPEDIENTE, --producción ARCHIVO
Archivo HDF5 donde se guardó el sinograma procesado, por defecto diff_tomo.h5
-v, --verboso
cambiar al modo detallado / depuración, predeterminado: silencioso
-P EXPEDIENTE, --prefijo ARCHIVO
Prefijo o base común para todos los archivos
-e EXTENSIÓN, --extensión EXTENSIÓN
Procesar todos los archivos con esta extensión
-t NTRANS, --nTrans NTRANS
número de puntos en la traducción. Obligatorio
-r NO, --nRot NROT
número de puntos en rotación. Obligatorio
-c NDIF, --nDif NDIF
número de puntos en el patrón de difracción en polvo, Obligatorio
-d EXPEDIENTE, --oscuro ARCHIVO
lista de imágenes oscuras para promediar y restar
-f EXPEDIENTE, --plano ARCHIVO
lista de imágenes planas para promediar y dividir
-m EXPEDIENTE, --máscara ARCHIVO
archivo que contiene la máscara, sin máscara por defecto
-p EXPEDIENTE, --poni ARCHIVO
archivo que contiene el parámetro de difracción (archivo poni), Obligatorio
-O COMPENSAR, --compensar OFFSET
no procese los primeros archivos
-g, --gpu
proceso usando OpenCL en GPU
-S, - estadísticas
mostrar estadísticas al final
Si la cantidad de archivos es demasiado grande, use comillas dobles "* .edf"
Use diff_tomo en línea usando los servicios de onworks.net