LAdump - Online en la nube

Este es el comando LAdump que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.

PROGRAMA:

NOMBRE


LAdump: muestra las alineaciones locales del daligner en un formato simple

SINOPSIS


LA volcado [-cdt] [-o] src1: db | presa [ src2: db | presa ] alinear: las [ lee: ARCHIVO | lee: rango ...]

DESCRIPCIÓN


Me gusta LAmostrar(1) LA volcado permite mostrar las alineaciones locales (LA) de un subconjunto de la
pilas en un archivo .las y seleccione qué información mostrar sobre ellas. La diferencia es
que la información está escrita en un formato ASCII de "1 código" muy simple que lo hace fácil
para que uno lea y analice la información para su uso posterior. Para cada LA el par de lecturas
se emite en una línea. -c solicita que una salida adicional de las coordenadas de la LA
Se emitirán segmentos. los -d La opción solicita que el número de diferencia en la LA sea
salida, y -t solicita que se envíe la información del punto de rastreo. Finalmente, -o solicitudes
que solo se generen AL que se superponen correctamente.

El formato es muy sencillo. Cada información solicitada aparece en una línea. los
El primer carácter de cada línea es un carácter de "1 código" que le indica qué información
esperar en la línea. El resto de la línea contiene información sobre dónde se encuentra cada elemento.
separados por un solo espacio en blanco. La línea del punto de seguimiento indica el número de puntos de seguimiento.
intervalos en el LA y es seguido inmediatamente por ese número de líneas que contienen un par de
enteros que dan el número de diferencias y el desplazamiento b en cada punto de seguimiento sucesivo
intervalo.

P #a #b - (# a, # b) tienen un LA entre ellos
C #ab #ae #bb #be - [# ab, # ae] se alinea con [# bb, # be]
D # - hay # diferencias en LA
T #n - hay #n intervalos de puntos de rastreo para LA
(#d #y) ^ # n - hay una diferencia #d que alinea los #y pb de B con el
siguiente intervalo de tamaño fijo de A
+ X # - Cantidad total de X (X = P o T)
% X # - Cantidad máxima de X en cualquier pila (X = P o T)
@ T #: número máximo de puntos de seguimiento en cualquier seguimiento

Las líneas de 1 código que comienzan con +,% o @ son siempre las primeras líneas de la salida. Ellos
dar información sobre el tamaño del contenido de la salida. Específicamente, '+ X #' da
el número total de LA (X = P), o el número total de intervalos de puntos de rastreo (X = T) en el
expediente . '% X #' da el número máximo de LA (X = P) o el número máximo de puntos de seguimiento
intervalos (X = T) en un determinado se acumulan (colección de LA, todas con la misma lectura a (se aplica solo
to sorted Finalmente @ T # da el número máximo de intervalos de puntos de rastreo en cualquier rastreo dentro de
el archivo.

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