Il s'agit de la commande fasta2DB qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fasta2DB - créer une base de données Dazzler à partir de fichiers fasta
SYNOPSIS
fasta2DB [-v] chemin:db {-ffilet | entrée:fasta ...}
DESCRIPTION
Construit une base de données initiale, ou ajoute à une base de données existante, la liste des fichiers .fasta
suivant l'argument du nom de la base de données, ou si le -f est utilisée, la liste des .fasta
les fichiers filet. Un fichier .fasta donné ne peut être ajouté qu'une seule fois à la base de données (ceci est vérifié par
la commande). Les en-têtes .fasta doivent être au format "Pacbio" (c'est-à-dire la sortie du
Les outils Pacbio ou nos soustraire(1) programme) et le puits, l'intervalle d'impulsion et la qualité de lecture
sont extraits de l'en-tête et conservés avec chaque enregistrement lu. Si les fichiers sont
ajouté à une base de données existante et les paramètres de partition de la base de données ont déjà été définis
(voir Division de la base de données(1)), puis le partitionnement de la base de données est mis à jour pour inclure le nouveau
revendre.
Utilisez fasta2DB en ligne en utilisant les services onworks.net