Il s'agit de la commande mbfa-mpi qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
mbfa - Convertisseur de format binaire FASTA Murasaki
SYNOPSIS
mbfa [options...] [input] [input2 ...] #convertir [input] et [input2 ...] en fichiers Muraaski Binary FASTA
DESCRIPTION
Murasaki traite les données de séquence en utilisant un format à 2 bits où chaque base est représentée en utilisant
2 bits. Il existe un certain nombre de formats préexistants qui font des choses similaires, mais dans
particulier Murasaki a besoin de connaître les métadonnées qui ne peuvent pas être exprimées en seulement 2
bits (par exemple, là où se trouvent les séquences de NNNN, les séquences se cassent lorsque plusieurs séquences sont
inclus dans un fichier FASTA, etc.), le format MBFA inclut donc également ces données.
Normalement, ces fichiers sont générés automatiquement par Murasaki lors de la première exécution sur un nouveau
séquence.
Parce que le format de fichier est conçu en étroite collaboration avec Murasaki, l'extension de fichier réelle
variera pour refléter votre architecture. Ce sera généralement une forme de .mbfa[48][48]
(par exemple ".mbfa88" (la version par défaut de gcc sur un amd64)).
OPTIONS
--info|-i
Afficher les métadonnées sur chaque MBFA spécifié.
--force|-f
Par défaut MBFA ignorera les fichiers qui ont déjà des fichiers .mbfa récents. Cette option
force la régénération de ces fichiers.
--fatal|-F
Rend les erreurs fatales. Normalement, si vous spécifiez plusieurs fichiers, mbfa essaiera de convertir
tous même si l'un échoue à émettre un avertissement. Avec --fatal, il s'arrêtera et sortira
avec une erreur s'il y a un problème.
--fasta|-A
Génère une sortie FASTA correspondant en fonction des données MBFA à la sortie standard.
--help|-h, --version|-V, --verbose|-V
Ce à quoi vous vous attendriez.
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