Il s'agit de la commande spin qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
spin - outil d'édition et d'analyse d'ADN (faisant partie du package staden)
SYNOPSIS
tourner [choix]
DESCRIPTION
Spin est un programme interactif et graphique d'analyse et de comparaison de séquences. Ce
contient des fonctions pour rechercher des sites de restriction, des séquences/motifs consensus et des protéines
régions codantes, peuvent analyser la composition de la séquence et traduire l'ADN en protéine.
Il contient également des fonctions pour localiser les segments de similitude au sein et entre
séquences, et pour trouver des alignements globaux et locaux entre des paires de séquences. Aider
évaluer la signification statistique des comparaisons le programme peut calculer des tableaux de
fréquences de score attendues et observées pour chaque niveau de score. La plupart des fonctions analytiques
qui opèrent sur des séquences simples ajoutent leurs résultats graphiques à un « Plot de séquence SPIN »
qui est associé à la séquence analysée. (Une exception est la restriction
recherche d'enzymes qui produit sa propre fenêtre séparée.) La plupart des fonctions qui comparent des paires
des séquences ajoutent leurs résultats à un « Plot de comparaison de séquences SPIN ». La séquence SPIN
Le tracé et le tracé de comparaison de séquence SPIN ont chacun des fenêtres d'affichage de séquence associées :
l'affichage de séquence et l'affichage de comparaison de séquence. Ceux-ci permettent le texte de la
séquences à visualiser et utilisez les curseurs pour afficher les positions correspondantes dans le
affichages graphiques. Les tracés graphiques peuvent être agrandis et les curseurs ou réticules peuvent être
utilisé pour localiser les positions des résultats individuels. Les parcelles peuvent être superposées.
OPTIONS
-carte de couleurs: Palette de couleurs pour la fenêtre principale
-afficher:
Affichage à utiliser
-géométrie: Géométrie initiale de la fenêtre
-patate douce:
Nom à utiliser pour l'application
-sync: Utiliser le mode synchrone pour le serveur d'affichage
-visuel:
Visuel pour la fenêtre principale
-utiliser: Id de la fenêtre dans laquelle intégrer l'application
--: Transmettez tous les arguments restants au script
Utilisez le spin en ligne à l'aide des services onworks.net