Il s'agit de l'application Linux nommée BALIGN dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom balign-windows-2010-06-26.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée BALIGN avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
BALIGNER
DESCRIPTION:
Aligneur de séquences par lots multifonctionnel incorporant les algorithmes Needleman-Wunsch, Smith-Waterman et Oommen-Kashyap ainsi qu'un alignement composé de séquences secondaires.
Fonctionnalités:
- Alignement global des séquences à l'aide de l'algorithme Needleman-Wunsch
- Alignement de séquences locales à l'aide de l'algorithme de Smith-Waterman
- Calcul de probabilité de transition à l'aide de l'algorithme d'Oommen-Kashyap
- Alignement composé de paires de séquences
- Le traitement par lots
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Eiffel
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/balign/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.