यह कमांड जीटी-मैचटूल है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
gt-matchtool - मिलान प्रारूपों को पार्स करें और/या मिलान उपकरण लागू करें।
SYNOPSIS
gt मैचटूल [विकल्प ...]
वर्णन
प्रकार [...]
मिलान फ़ाइल स्वरूप चुनें: OPENMATCH: खुला मैच प्रारूप, उदाहरण के लिए vmatch ब्लास्टआउट: सारणीबद्ध
ब्लास्ट आउटपुट (-m 8) BLASTALLP: ब्लास्टपी के साथ BLASTALL को प्रारंभ करें BLASTALLN: BLASTALL को प्रारंभ करें
ब्लास्टन के साथ BLASTP: ब्लास्टपी को लागू करें BLASTN: ब्लास्टन को लागू करें LAST: अंतिम को लागू करें SW: उपयोग करें
स्मिथ-वाटरमैन (डिफ़ॉल्ट: ओपनमैच)
-मैचफ़ाइल [फ़ाइल का नाम]
इनपुट फ़ाइल नाम सेट करें (डिफ़ॉल्ट: अपरिभाषित)
-डीबी [फ़ाइल का नाम]
डेटाबेस फ़ाइल नाम सेट करें (डिफ़ॉल्ट: अपरिभाषित)
-स्वमिनलेन [मूल्य]
न्यूनतम आवश्यक संरेखण लंबाई निर्धारित करें (स्मिथ-वाटरमैन संरेखण के लिए) (डिफ़ॉल्ट: 10)
-swmaxedist [मूल्य]
अधिकतम अनुमत संपादन दूरी निर्धारित करें (स्मिथ-वाटरमैन संरेखण के लिए) (डिफ़ॉल्ट: 0)
-जिज्ञासा [फ़ाइल का नाम]
क्वेरी फ़ाइल नाम सेट करें (डिफ़ॉल्ट: अपरिभाषित)
-मदद
सहायता प्रदर्शित करें और बाहर निकलें
-संस्करण
संस्करण की जानकारी प्रदर्शित करें और बाहर निकलें
रिपोर्टिंग बग
बग की रिपोर्ट करेंgt-users@genometools.org>.
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन gt-matchtool का उपयोग करें