यह iCAS नाम का लिनक्स ऐप है - लिनक्स में ऑनलाइन चलने के लिए एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम, जिसकी नवीनतम रिलीज़ को icas_v062.tar.bz2 के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
iCAS नामक इस ऐप को ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं - ऑनवर्क्स के साथ लिनक्स में ऑनलाइन चलाने के लिए एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
iCAS - लिनक्स में ऑनलाइन चलने के लिए एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम
विवरण:
बड़े और जटिल जीनोम के लिए उच्च गुणवत्ता वाली असेंबली प्राप्त करने के साधन के रूप में क्लोन-दर-क्लोन अनुक्रमण, उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण के युग में बहुत प्रासंगिक बना हुआ है। हालाँकि, वर्तमान संपूर्ण जीनोम असेंबलरों का उपयोग करके प्राप्त असेंबली अक्सर खंडित होती हैं और कभी-कभी मल्टीप्लेक्स अनुक्रमण द्वारा पेश की गई विभिन्न डेटा विशेषताओं के कारण जीनोम पूर्णता के मुद्दे होते हैं।आईसीएएस के साथ डेटा फ़िल्टरिंग प्रक्रिया एक नए किमीर फ़्रीक्वेंसी एल्गोरिदम पर आधारित है, जिसके परिणामस्वरूप प्री-असेंबली रीडिंग लगभग सही होती है। कॉन्टिग्स को विभिन्न असेंबली एल्गोरिदम का उपयोग करके उत्पन्न किया जाता है और फिर लंबी निरंतरता प्राप्त करने के लिए एक साथ विलय कर दिया जाता है। सभी रीड्स को ड्राफ्ट कॉन्टिग्स में पुन: संरेखित करने और प्रत्येक अनुक्रम आधार को पुन: कैलिब्रेट करने से अंतिम सहमति प्राप्त होती है। क्यूसी के लिए तैयार क्लोन का उपयोग करके, पाइपलाइन 99.7% के क्लोन कवरेज और क्यू39 की सर्वसम्मति आधार गुणवत्ता के साथ असेंबली प्राप्त करने में सक्षम है।
वेलकम ट्रस्ट सेंगर इंस्टीट्यूट में विकसित किया गया।
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
प्रोग्रामिंग भाषा
पर्ल, सी
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/icas/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।