Questo è il comando fasta2DB che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fasta2DB: crea un database Dazzler da file fasta
SINOSSI
fasta2DB [-v] percorso: db {-ffiletto | ingresso: veloce ...}
DESCRIZIONE
Costruisce un database iniziale o aggiunge a un database esistente l'elenco dei file .fasta
dopo l'argomento del nome del database o, se il -f viene utilizzata l'opzione .fasta
file in filetto. Un dato file .fasta può essere aggiunto solo una volta al DB (questo viene controllato da
il comando). Gli header .fasta devono essere nel formato "Pacbio" (ovvero l'output del file
Strumenti Pacbio o il nostro estratto(1) programma) e il pozzetto, l'intervallo degli impulsi e la qualità della lettura
vengono estratti dall'intestazione e conservati con ogni record letto. Se i file vengono
aggiunto a un database esistente e le impostazioni di partizione del DB sono già state configurate
(Vedi DB diviso(1)), quindi il partizionamento del database viene aggiornato per includere il nuovo
dati.
Utilizza fasta2DB online utilizzando i servizi onworks.net