Questa è l'app Linux chiamata AlphaGenome, la cui ultima versione può essere scaricata come v0.0.1sourcecode.tar.gz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app chiamata AlphaGenome con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI:
AlphaGenome
DESCRIZIONE:
L'API AlphaGenome fornisce l'accesso ad AlphaGenome, il modello unificatore di Google DeepMind per la decifrazione del codice regolatore all'interno delle sequenze di DNA. Questo repository contiene codice lato client, esempi e documentazione per aiutarti a utilizzare l'API AlphaGenome. AlphaGenome offre predizioni multimodali, che comprendono diversi output funzionali come espressione genica, modelli di splicing, caratteristiche della cromatina e mappe di contatto. Il modello analizza sequenze di DNA lunghe fino a 1 milione di coppie di basi e può fornire predizioni con risoluzione a singola coppia di basi per la maggior parte degli output. AlphaGenome raggiunge prestazioni all'avanguardia in una vasta gamma di benchmark di predizione genomica, inclusi numerosi e diversi compiti di predizione dell'effetto variante.
Caratteristiche
- Puoi iniziare ottenendo una chiave API
- I tutorial illustrano l'utilizzo esemplificativo del modello AlphaGenome
- Installa alphagenome localmente
- Esempi disponibili
- Documentazione disponibile
- AlphaGenome offre previsioni multimodali
Linguaggio di programmazione
Python
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/alphagenome.mirror/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.