זוהי הפקודה ecofind שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
ecofind - חיפוש אחר טקסונומי ומזהה דירוג וטקסונומיה עבור ביטוי רגולרי נתון
דפוסי
תיאור
ecoPCR היא תוכנת PCR אלקטרונית שפותחה על ידי LECA ו- Helix-Project. זה עוזר ל
להעריך את איכות הפריימרים של ברקוד.
תוכנית זו שייכת לחבילת exoPCR.
תַקצִיר
ecofind [אפשרויות]
אפשרויות
-a : [א]יאפשר את החיפוש בכל השמות החלופיים ולא רק בשמות מדעיים.
-d : [D]atabase המכיל את הטקסונומיה.
כדי להתאים לפורמט הצפוי, יש לעצב תחילה את מסד הנתונים על ידי
תוכנית ecoPCRFormat.py הממוקמת בספריית הכלים. כתוב את מסד הנתונים רדיקלי
ללא כל הארכה.
-h : [H]עזרה - הדפס עֶזרָה
-l : [L]רשום את כל הדרגות הטקסונומיות הזמינות עבור -r אוֹפְּצִיָה
-P : [P]ath : הוסף עמודה המכילה את הנתיב המלא עבור כל טקסון המוצג
-p : [P]parents : ציון אפשרות זו מציג את כל המידע של עץ ההורים עבור
נתון תקוע.
-r : [ר]הגביל לדרגה טקסונומית נתונה
-s : [S]ons: ציון אפשרות זו מציג את כל המידע של תת-עץ עבור הנתון
מספר זהות לצורך מס.
-P : הצג [P]ath טקסונומי כעמודה משלימה בפלט
טיעונים:
תבנית שמות הנושאת ביטויים רגולריים
השתמש ב-ecofind באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net