fsl - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

fsl - כלי ניתוח להדמיית מוח FMRI, MRI ו-DTI

תיאור

FSL הוא ערכת כלים מקיפה לניתוח נתוני הדמיה רפואית של המוח.
מספק כלים לעיבוד נתונים מקדים, חילוץ מוח, רישום תמונות וכן
מגוון רחב של ניתוחים סטטיסטיים. FSL מספק ממשק משתמש גרפי קל לשימוש.

FSL דורש הגדרה נכונה של מספר משתני סביבה. כדי להשיג זאת,
אנא קבל את מקור סקריפט ההגדרות מ-/etc/fsl/5.0/fsl.sh. דרך אחת לעשות זאת
באופן אוטומטי הוא להוסיף שורה המכילה

. /etc/fsl/5.0/fsl.sh

לקובץ .bashrc בתיקיית הבית של המשתמש (או קובץ מקביל עבור קליפות אחרות)
ייתכן שתצטרך ליצור קובץ כזה תחילה.

לחלופין, חבילת דביאן מתקינה קישורים סימבוליים (symlinks) עבור כל כלי ה-FSL ב- / usr / bin זֶה
דאגו לטעינת התצורה המתאימה באופן אוטומטי. שמות הקישורים הסימליים הם
עם קידומת המתאים FSL גרסה כדי למנוע התנגשויות בשמות קבצים ולאפשר
מספר גרסאות להתקיים יחד באותה מערכת. לדוגמה, ה- פרוס פקודה היא
זמין כ fsl5.0-slicerשימו לב כי לשימוש FSL כלים דרך קישורי סימבוליות אלה
לֹא הכרחי לביצוע הליך ההתקנה המתואר לעיל. עם זאת, נוחות זו
התכונה ספציפית לדביאן. סקריפטים המשתמשים בפקודות FSL ומיועדים לשיתוף.
עם אחרים, עליהם להסתמך על שמות פקודות ללא קידומות ועל משתנה הסביבה FSL
להכין.

השמיים FSL ממשק משתמש לפעמים מתייחס ל- FSLDIRבמערכות דביאן זה כך
/usr/share/fsl/5.0 עבור FSL גרסה 5.0.

FSL תיעוד ועזרה מקוונת מסופקים על ידי fsl-5.0-doc חֲבִילָה.

שאלות בנוגע לשימוש ב FSL או תיאוריה קשורה ניתן לפרסם ב- FSL דיוור
רשימה (ראה http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).

מקבילה

ניתן להגדיר את FSL כך שיגיש עבודות למנוע Sun Griden (SGE) פעיל. אמנם לא כולם
פונקציונליות המיושמת ב-FSL תומכת בסוג זה של מקביליות, התובענית ביותר
כלי עיבוד (למשל POSSUM ו-FDT) כן.

FSL אמור להיות מסוגל להשתמש ב-SGE גם אם משתנה הסביבה SGE_ROOT אינו מוגדר, כמו ב-
במקרה של חבילת דביאן של SGE. כדי לאפשר עיבוד אצווה, פשוט הגדר

FSLPARALLEL=1

במעטפת שבה פועל FSL. ניתן להפעיל זאת לצמיתות ב

/etc/fsl/5.0/fsl.sh

או על בסיס כל מקרה לגופו.

השתמש ב-fsl באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net