זוהי אפליקציית לינוקס בשם ADOMA שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם adoma-1.0.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם ADOMA עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צילומי מסך:
ADOMA
תיאור:
ADOMA ראשי תיבות של: Alternative Display Of Multiple Alignment. ADOMA יכולה ליצור ארבע תצוגות שונות של יישור רצף מרובה: יישור ClustalW בפורמט HTML, יישור ClustalW פשוט בפורמט HTML ו/או txt ויישור ClustalW צבעוני בפורמט HTML. לדוגמאות של קבצי פלט אלה, בדוק את צילומי המסך. ADOMA משתמשת ב-ClustalW כדי ליצור את היישור המרובה מרצפי DNA או חלבונים ומציגה אותם מעט שונים מהפלט הרגיל של ClustalW. ADOMA היא תוכנית שורת פקודה שניתן להשתמש בה בקלות בצינורות.
למידע נוסף, עיין ב-README.md בסעיף קבצים.
איך לצטט את ADOMA:
Zaal, D. and Nota, B. (2016), ADOMA: A Command Line Tool to Modify ClustalW Multiple Alignment Output. מול. אינפ., 35: 42–44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
Unix Shell, Python
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/adoma/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.