Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 gt-matchtool 명령입니다.
프로그램:
이름
gt-matchtool - 일치 형식을 구문 분석하거나 일치 도구를 호출합니다.
개요
gt 성냥개비 [옵션 ...]
기술
-유형 [...]
일치 파일 형식 선택: OPENMATCH: 열 수 일치 형식(예: vmatch BLASTOUT: 테이블 형식)
BLAST 출력 (-m 8) BLASTALLP: blastp로 BLASTALL을 호출합니다. BLASTALLN: BLASTALL을 호출합니다.
blastn 사용 BLASTP : blastp 호출 BLASTN : blastn 호출 LAST : LAST SW 호출 : 사용
Smith-Waterman(기본값: OPENMATCH)
-성냥 파일 [파일 이름]
입력 파일 이름 설정 (기본값: 정의되지 않음)
-DB [파일 이름]
데이터베이스 파일 이름 설정 (기본값: 정의되지 않음)
-swminlen [가치]
필요한 최소 정렬 길이 설정(Smith-Waterman 정렬의 경우)(기본값: 10)
-swmaxedist [가치]
허용되는 최대 편집 거리 설정(Smith-Waterman 정렬의 경우)(기본값: 0)
-질문 [파일 이름]
쿼리 파일 이름 설정 (기본값: 정의되지 않음)
-도움
도움말 표시 및 종료
-번역
버전 정보 표시 및 종료
보고 버그
버그 보고gt-users@genometools.org>.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 gt-matchtool을 사용하세요.