ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gt-tallymer-mkindex ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gt-tallymer-mkindex - ນັບແລະດັດສະນີ k-mers ໃນ array suffix ປັບປຸງໃຫ້ສໍາລັບ a
ມູນຄ່າຄົງທີ່ຂອງ k.
ສະຫຼຸບສັງລວມ
gt ໂຕລີເມີ mkindex [ຕົວເລືອກ] -esa suffixerator-index [ຕົວເລືອກ]
ລາຍລະອຽດ
-esa [string]
ລະບຸ suffixerator-index (ທາງເລືອກທີ່ບັງຄັບ) (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)
-mersize [ມູນຄ່າ]
ລະບຸຂະຫນາດ mer. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 20)
-minocc [ມູນຄ່າ]
ລະບຸຕົວເລກການປະກົດຕົວຂັ້ນຕໍ່າສໍາລັບ mers ທີ່ຈະອອກ/ດັດສະນີ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0)
-maxocc [ມູນຄ່າ]
ລະບຸຕົວເລກການປະກົດຕົວສູງສຸດສໍາລັບ mers ທີ່ຈະສົ່ງອອກ/ດັດສະນີ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0)
-pl [ມູນຄ່າ]
ລະບຸຄວາມຍາວຄໍານໍາຫນ້າສໍາລັບການແນະນໍາການກໍ່ສ້າງຂອບເຂດ bucket: ໃຊ້ໂດຍບໍ່ມີການ
ການໂຕ້ຖຽງ; ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ຄວາມຍາວຂອງຄໍານໍາຫນ້າທີ່ເຫມາະສົມແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍອັດຕະໂນມັດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0)
-ຊື່ດັດສະນີ [string]
ເກັບຮັກສາ mers ທີ່ລະບຸໄວ້ໂດຍທາງເລືອກ -maxocc ແລະ -minocc ໃນດັດຊະນີ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ:
ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)
- ນັບ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ເກັບຮັກສາຈໍານວນ mers (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
- ສະແກນ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ອ່ານ array suffix ປັບປຸງຕາມລໍາດັບແທນທີ່ຈະສ້າງແຜນທີ່ມັນໄວ້ໃນຫນ່ວຍຄວາມຈໍາ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-v [ແມ່ນ|ບໍ່]
be verbose (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອແລະອອກ
-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ
ການລາຍງານ ບັກ
ລາຍງານບັກຫາkurtz@zbh.uni-hamburg.de>.
ໃຊ້ gt-tallymer-mkindex ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net