ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ nichenetr ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ເປັນ v2.0.4.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ nichenetr ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
nichenetr
DESCRIPTION:
nichenetr: ການປະຕິບັດ R ຂອງວິທີການ NicheNet. ເປົ້າຫມາຍຂອງ NicheNet ແມ່ນເພື່ອສຶກສາການສື່ສານລະຫວ່າງຈຸລັງຈາກທັດສະນະການຄິດໄລ່. NicheNet ໃຊ້ຂໍ້ມູນການສະແດງອອກ gene ຂອງມະນຸດຫຼືຫນູຂອງຈຸລັງປະຕິສໍາພັນເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນແລະປະສົມປະສານນີ້ກັບຮູບແບບກ່ອນທີ່ປະສົມປະສານຄວາມຮູ້ທີ່ມີຢູ່ແລ້ວກ່ຽວກັບເສັ້ນທາງສັນຍານ ligand-to-target. ນີ້ອະນຸຍາດໃຫ້ຄາດຄະເນການໂຕ້ຕອບ ligand-receptor ທີ່ອາດຈະເຮັດໃຫ້ການປ່ຽນແປງການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນຈຸລັງທີ່ມີຄວາມສົນໃຈ. ຮູບແບບຂອງຂໍ້ມູນເບື້ອງຕົ້ນນີ້ກ່ຽວກັບການເຊື່ອມຕໍ່ ligand-target ທີ່ເປັນໄປໄດ້ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອ infer ການເຊື່ອມຕໍ່ ligand-target ທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວລະຫວ່າງຈຸລັງການໂຕ້ຕອບ. NicheNet ຈັດລໍາດັບຄວາມສໍາຄັນຂອງ ligands ອີງຕາມກິດຈະກໍາຂອງເຂົາເຈົ້າ (ie, ເຮັດແນວໃດດີ, ພວກເຂົາເຈົ້າຄາດຄະເນການປ່ຽນແປງການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນຈຸລັງຮັບ) ແລະຊອກຫາເປົ້າຫມາຍທີ່ມີຜົນກະທົບທີ່ມີທ່າແຮງສູງທີ່ຈະຄວບຄຸມໂດຍ ligands ບູລິມະສິດເຫຼົ່ານີ້.
ຄຸນລັກສະນະ
- NicheNet ມີຄວາມແຕກຕ່າງກັນຢ່າງຫຼວງຫຼາຍຈາກວິທີການຄິດໄລ່ໃນປະຈຸບັນຫຼາຍທີ່ສຸດໃນການສຶກສາການສື່ສານລະຫວ່າງຈຸລັງ
- ປະເມີນວ່າ ligands ສະແດງອອກໂດຍຈຸລັງຜູ້ສົ່ງສາມາດຄາດຄະເນການປ່ຽນແປງຂອງການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນຈຸລັງຜູ້ຮັບທີ່ຈັດລໍາດັບຄວາມສໍາຄັນຂອງ ligands ໂດຍອີງໃສ່ຜົນກະທົບຂອງມັນຕໍ່ການສະແດງອອກຂອງ gene.
- Infer putative ligand-target links ມີການເຄື່ອນໄຫວຢູ່ໃນລະບົບທີ່ກໍາລັງສຶກສາຢູ່
- ກວດສອບຕົວແບບ ligand-target ກ່ອນ
- ການສ້າງແບບຈໍາລອງ ligand-target ລ່ວງໜ້າທີ່ກຳນົດໂດຍຜູ້ໃຊ້
- ພວກເຮົາໃຫ້ຄໍາແນະນໍາກ່ຽວກັບວິທີເຮັດໃຫ້ການເບິ່ງເຫັນ intuitive ຂອງການຄາດຄະເນຕົ້ນຕໍ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
R
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/nichenetr.mirror/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ດ້ວຍວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.