STAR - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന STAR കമാൻഡ് ആണിത്.

പട്ടിക:

NAME


STAR - അൾട്രാഫാസ്റ്റ് യൂണിവേഴ്സൽ RNA-seq അലൈനർ

വിവരണം


മുമ്പത്തെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഒരു റഫറൻസ് (STAR) സോഫ്‌റ്റ്‌വെയറിലേക്കുള്ള സ്‌പ്ലൈസ്ഡ് ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റ് അലൈൻമെൻ്റ്
വിവരിക്കാത്ത RNA-seq അലൈൻമെൻ്റ് അൽഗോരിതം, അത് അനുക്രമമായ പരമാവധി മാപ്പബിൾ വിത്ത് തിരയൽ ഉപയോഗിക്കുന്നു
വിത്ത് ക്ലസ്റ്ററിംഗും സ്റ്റിച്ചിംഗ് നടപടിക്രമവും പിന്തുടരുന്ന കംപ്രസ് ചെയ്യാത്ത സഫിക്സ് അറേകളിൽ. നക്ഷത്രം
മാപ്പിംഗ് വേഗതയിൽ മറ്റ് അലൈനറുകളെക്കാൾ>50 എന്ന ഘടകം കൊണ്ട് മികച്ച പ്രകടനം കാഴ്ചവെക്കുന്നു, മനുഷ്യനുമായി വിന്യസിക്കുന്നു
ജീനോം 550 മില്യൺ 2 × 76 ബിപി പെയർ-എൻഡ് റീഡുകൾ ഒരു മിതമായ 12-കോർ സെർവറിൽ മണിക്കൂറിൽ
അതേ സമയം വിന്യാസ സംവേദനക്ഷമതയും കൃത്യതയും മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നു. കൂടാതെ നിഷ്പക്ഷമായ ഡി
കാനോനിക്കൽ ജംഗ്‌ഷനുകളുടെ നോവോ ഡിറ്റക്ഷൻ, സ്റ്റാറിന് കാനോനിക്കൽ അല്ലാത്ത സ്‌പ്ലൈസുകൾ കണ്ടെത്താനാകും
ചിമെറിക് (ഫ്യൂഷൻ) ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ, കൂടാതെ മുഴുനീള ആർഎൻഎ സീക്വൻസുകൾ മാപ്പ് ചെയ്യാനും കഴിയും.
റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ പോളിമറേസ് ചെയിൻ റിയാക്ഷൻ ആംപ്ലിക്കോണുകളുടെ റോച്ചെ 454 സീക്വൻസിങ് ഉപയോഗിച്ച്,
1960-ലെ നോവൽ ഇൻ്റർജെനിക് സ്‌പ്ലൈസ് ജംഗ്ഷനുകൾ 80-90% ഉപയോഗിച്ച് രചയിതാക്കൾ പരീക്ഷണാത്മകമായി സാധൂകരിച്ചു.
വിജയ നിരക്ക്, STAR മാപ്പിംഗ് തന്ത്രത്തിൻ്റെ ഉയർന്ന കൃത്യതയെ സ്ഥിരീകരിക്കുന്നു.

സിനോപ്സിസ്


STAR --ഓപ്ഷൻ1-പേര് option1-value(s)--option2-name ഓപ്ഷൻ2-മൂല്യം(കൾ) ...

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് STAR ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക



ഏറ്റവും പുതിയ ലിനക്സ്, വിൻഡോസ് ഓൺലൈൻ പ്രോഗ്രാമുകൾ