xcrysden - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

xcrysden - ക്രിസ്റ്റലിൻ, മോളിക്യുലാർ ഘടന വിഷ്വലൈസർ

സിനോപ്സിസ്

xcrysden [പ്രത്യേക-ഓപ്ഷനുകൾ]
xcrysden [പ്രത്യേക-ഓപ്ഷനുകൾ] ഫോർമാറ്റ്-ഓപ്ഷനുകൾ ഫയല്|ഡയറക്ടറി

വിവരണം

XCrySDen ക്രിസ്റ്റലിൻ, മോളിക്യുലാർ സ്ട്രക്ച്ചർ വിഷ്വലൈസേഷൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ഇത് ലക്ഷ്യമിടുന്നത്
ക്രിസ്റ്റലിൻ ഘടനകളിൽ സൂപ്പർഇമ്പോസ് ചെയ്യാവുന്ന ഐസോസർഫേസുകളുടെയും കോണ്ടൂരുകളുടെയും പ്രദർശനം
ഒപ്പം സംവേദനാത്മകമായി കറങ്ങുകയും കൈകാര്യം ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു.

പ്രത്യേക ഓപ്ഷനുകൾ

-h
--സഹായിക്കൂ
സഹായ സന്ദേശം പ്രദർശിപ്പിക്കുക.

-v
--പതിപ്പ്
പ്രോഗ്രാം പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുക.

-u id
--ഉപയോഗിക്കുക id
window-ID= ഉപയോഗിച്ച് കണ്ടെയ്‌നർ വിൻഡോയിൽ ഉൾച്ചേർത്ത XCrySDen ലോഡ് ചെയ്യുകid.

-r മങ്ങിയത്
--കുറച്ചു മങ്ങിയത്
XSF ഫയലിന്റെ ആനുകാലിക അളവ് കുറയ്ക്കുക മങ്ങിയത്. മുമ്പ് വ്യക്തമാക്കണം --xsf ഓപ്ഷൻ,
ഉദാ. xcrysden -r 2 --xsf ഫയല്.

-c ഫയല്
--ഇഷ്ടം ഫയല്
ഒരു നിർദ്ദിഷ്‌ട ഫയലിൽ നിന്ന് ഇഷ്‌ടാനുസൃത-നിർവചനങ്ങൾ ലോഡുചെയ്യുക (സിന്റക്‌സ്
~/.xcrysden/കസ്റ്റം-നിർവചനങ്ങൾ).

-a ഫയല്
--ഗുണവിശേഷങ്ങൾ ഫയല്
ഫയലിൽ നിന്ന് ആട്രിബ്യൂട്ടുകൾ ലോഡ് ചെയ്യുക. ആട്രിബ്യൂട്ടുകളുടെ ഫയലിന്റെ ഫോർമാറ്റ് ഇനിപ്പറയുന്നതാണ്:

എലമെന്റ് കളർ
ആറ്റോമിക്-നമ്പർ1 red1 നീല XXX പച്ച 1
ആറ്റോമിക്-നമ്പർ2 red2 നീല XXX പച്ച 2
...
എലമെന്റ്റേഡിയസ്
ആറ്റോമിക്-നമ്പർ1 ആരം1
ആറ്റോമിക്-നമ്പർ2 ആരം2
...

-l ഫയല്
--ലൈറ്റുകൾ ഫയല്
XCrySDen-ന്റെ ലൈറ്റ് ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത ഫയലിൽ നിന്ന് ലൈറ്റ് പാരാമീറ്ററുകൾ ലോഡ് ചെയ്യുക.

ഫോർമാറ്റ് ഓപ്ഷനുകൾ

--xsf ഫയല്
XCrySDen's-Structure-File (XSF) ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത ഫയലിൽ നിന്ന് ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക.

--animxsf ഫയല്
--axsf ഫയല്
Animated-XCrySDen's-Structure-File (AXSF) ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത ഫയലിൽ നിന്ന് സ്ട്രക്‌റ്റുകൾ ലോഡുചെയ്യുക.

--bxsf ഫയല്
BXSF (Band-XSF) ഫയലിൽ നിന്ന് ബാൻഡുകൾ ലോഡുചെയ്‌ത് ഫെർമി ഉപരിതലം ദൃശ്യവൽക്കരിക്കുക.

--xmol ഫയല്
--xyz ഫയല്
XYZ ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത ഫയലിൽ നിന്ന് ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക.

--pdb ഫയല്
PDB ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത ഫയലിൽ നിന്ന് ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക.

--gzmat ഫയല്
Gaussian Z-matrix-ൽ നിന്നുള്ള ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക (ഓപ്പൺ-ബാബേൽ പ്രോഗ്രാം ആവശ്യമാണ്).

--gaussian_out ഫയല്
--gxx_out ഫയല്
--g98_out ഫയല്
Gaussian ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിൽ നിന്ന് ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക. ഒരൊറ്റ പോയിന്റ് കണക്കുകൂട്ടൽ മാത്രം
ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ റൺ ഇതുവരെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു. ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ റണ്ണിനായി അത് സാധ്യമാണ്
റൺ സമയത്ത് നിർമ്മിച്ച എല്ലാ ഘടനകളും റെൻഡർ ചെയ്യുക.

--ക്യൂബ് ഫയല്
--gXX_cube ഫയല്
--g98_ക്യൂബ് ഫയല്
ഗാസിയൻ ക്യൂബ് ഫയലിൽ നിന്ന് ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക. കൂടെ ക്യൂബ് ഫയൽ ഹാജരാക്കണം
ക്യൂബ്=കാർഡ് ഓപ്ഷൻ. സ്കെയിലർ ക്യൂബ് ഫയലുകൾ മാത്രമേ പിന്തുണയ്ക്കൂ, അതായത്, ക്യൂബ്=(കാർഡുകൾ, സാന്ദ്രത)
അല്ലെങ്കിൽ ക്യൂബ്=(കാർഡുകൾ, ഓർബിറ്റലുകൾ) അല്ലെങ്കിൽ ക്യൂബ്=(കാർഡുകൾ, സാധ്യത). ഇതിനായി GAUSSIAN മാനുവൽ കാണുക
ഈ കീവേഡുകളുടെ അർത്ഥം.

--ക്രിസ്റ്റൽ_ഇൻപി ഫയല്
ക്രിസ്റ്റലിൽ നിന്നുള്ള ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക (http://http//www.crystal.unito.it/) ഇൻപുട്ട് ഫയൽ.

--ക്രിസ്റ്റൽ_f9 ഫയല്
ക്രിസ്റ്റലിൽ നിന്നുള്ള ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക (http://http//www.crystal.unito.it/) ഫോർട്രാൻ യൂണിറ്റ് 9.

--wien_struct ഫയൽഹെഡ്|ഫയല്|ഡയറക്ടറി
WIEN2k-ൽ നിന്നുള്ള ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക (http://www.wien2k.at/) struct-file, എവിടെ:

ഫയൽഹെഡ് = ഇല്ലാത്ത struct ഫയലിന്റെ പേര് .struct വിപുലീകരണം,
ഫയല് = ഫയലിന്റെ പേര്,
ഡയറക്ടറി = കേസ് ഡയറക്ടറിയുടെ പേര്.

--wien_kpath ഡയറക്ടറി|struct-file
വായിക്കുക സ്ട്രക്റ്റ് പ്രത്യേക k-പോയിന്റുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ആദ്യത്തെ Brillouin സോൺ ഫയൽ ചെയ്ത് റെൻഡർ ചെയ്യുക. കെ-പാത്ത് ആകാം
പ്രത്യേക k-പോയിന്റുകളിൽ മൗസ് ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് ഇന്ററാക്ടീവ് ആയി തിരഞ്ഞെടുത്തു. ഉപയോക്താവ് വ്യക്തമാക്കണം EMIN
ഒപ്പം ഇമാക്സ് ഊർജ്ജവും പാതയിലെ മൊത്തം കെ-പോയിന്റുകളുടെ എണ്ണവും. ഈ സംഖ്യ വെറും
XCrySDen വളരെ യൂണിഫോം ആകാൻ ശ്രമിക്കുന്നതിനാൽ മൊത്തം കെ-പോയിന്റുകളുടെ ഒരു ഏകദേശ കണക്ക്
പാതയിലെ കെ-പോയിന്റുകളുടെ സാമ്പിൾ (WIEN2k അനുവദനീയമായ പരമാവധി എണ്ണം k- എന്ന് വ്യക്തമാക്കരുത്
പോയിന്റുകൾ, കാരണം XCrySDen കുറച്ച് പോയിന്റുകൾ കൂടി സൃഷ്ടിച്ചേക്കാം).

--wien_renderdensity ഡയറക്ടറി
വായിക്കുക സ്ട്രക്റ്റ്, ഔട്ട്പുട്ട്, ഒപ്പം rho ഫയലുകളും റെൻഡർ ക്രിസ്റ്റലിൻ ഘടനയും പ്രീകംപ്യൂട്ടഡ്
ചാർജ് സാന്ദ്രത.

--wien_density ഡയറിക്കറി
ചാർജ് സാന്ദ്രത കണക്കുകൂട്ടുന്നതിനുള്ള 2D അല്ലെങ്കിൽ 3D മേഖല സംവേദനാത്മകമായി തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു
മൗസ്-ക്ലിക്കിംഗ്. XCrySDen സൃഷ്ടിക്കുന്നു in5 ഫയൽ(കൾ), ചാർജ് സാന്ദ്രത കണക്കാക്കുകയും റെൻഡർ ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു
ഒന്നുകിൽ ഐസോലിനുകൾ/വർണ്ണവിമാനങ്ങൾ (2D) അല്ലെങ്കിൽ ഐസോസർഫേസുകൾ (3D).

--wien_fermisurface ഡയറക്ടറി
ഫെർമി ഉപരിതലം സൃഷ്ടിക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു ടാസ്‌ക് വിൻഡോ പോപ്പ്-അപ്പ് ചെയ്യുക. നിരവധി ഘട്ടങ്ങൾക്ക് ശേഷം ഫെർമി
ഉപരിതലം (പ്രതീക്ഷയോടെ) 3D ഐസോസർഫേസായി വരച്ചിരിക്കുന്നു.

--ഫ്ഹി_ഇൻപിനി ഫയല്
FHI98MD-ൽ നിന്നുള്ള ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക inp.ini രൂപപ്പെടുത്തിയ ഫയൽ.

--fhi_coord ഫയല്
FHI98MD-ൽ നിന്നുള്ള ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക coord.out രൂപപ്പെടുത്തിയ ഫയൽ.

--pwi
--pw_inp ഫയല്
മുതൽ ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക pw.x ഇൻപുട്ട് ഫയൽ. pw.x എന്ന സ്യൂഡോപൊട്ടൻഷ്യൽ പ്ലാൻ വേവ് പ്രോഗ്രാമാണ്
ക്വാണ്ടം-എസ്പ്രെസ്സോ വിതരണം (http://www.quantum-espresso.org/).

--pwo
--pw_out ഫയല്
മുതൽ ഘടന ലോഡ് ചെയ്യുക pw.x ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ. pw.x എന്ന സ്യൂഡോപൊട്ടൻഷ്യൽ പ്ലാൻ വേവ് പ്രോഗ്രാമാണ്
ക്വാണ്ടം-എസ്പ്രെസ്സോ വിതരണം (http://www.quantum-espresso.org/).

-s സ്ക്രിപ്റ്റ്
--സ്ക്രിപ്റ്റ് സ്ക്രിപ്റ്റ്
Tcl സ്ക്രിപ്റ്റ് അടങ്ങിയ ഫയലിൽ നിന്ന് സ്ക്രിപ്റ്റ് ലോഡ് ചെയ്യുക.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് xcrysden ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക