ലിനക്സ് ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ NGSEP എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിൻ്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് NGSEPcore_4.0.1.jar ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി Linux-ൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ NGSEP എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
എൻജിഎസ്ഇപി ഓൺലൈനിൽ ലിനക്സിൽ പ്രവർത്തിക്കും
വിവരണം
ഡിഎൻഎ ഹൈ ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിങ് ഡാറ്റ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു സംയോജിത ചട്ടക്കൂടാണ് NGSEP. NGSEP യുടെ പ്രധാന ഉപയോഗം ജനിതക വ്യതിയാനത്തിന്റെ വലിയ ഡാറ്റാസെറ്റുകളുടെ നിർമ്മാണവും ഡൗൺസ്ട്രീം വിശകലനവുമാണ്. സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് വേരിയന്റുകൾ (എസ്എൻവികൾ), ചെറുതും വലുതുമായ ഇൻഡലുകൾ, ഷോർട്ട് ടാൻഡം റിപ്പീറ്റുകൾ (എസ്ടിആർ), വിപരീതങ്ങൾ, കോപ്പി നമ്പർ വേരിയന്റുകൾ (സിഎൻവികൾ) എന്നിവയുടെ കൃത്യമായ കണ്ടെത്തലും ജനിതക രൂപീകരണവും എൻജിഎസ്ഇപി നിർവഹിക്കുന്നു. പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനം, ഫിൽട്ടറിംഗ്, ഫോർമാറ്റ് പരിവർത്തനം, താരതമ്യം, ക്ലസ്റ്ററിംഗ്, ഇംപ്യൂട്ടേഷൻ, ഇൻട്രോഗ്രെഷൻ വിശകലനം, വ്യത്യസ്ത തരം സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ എന്നിവയ്‌ക്കായുള്ള മൊഡ്യൂളുകളും NGSEP നൽകുന്നു. പ്രവർത്തനങ്ങളുടെ പൂർണ്ണമായ ലിസ്റ്റ് ഞങ്ങളുടെ വിക്കിയിൽ ലഭ്യമാണ് (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).വാർത്ത: എഫ്എം-ഇൻഡക്സ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള റീഡ് അലൈനറിന്റെ സ്വന്തം നിർവ്വഹണം ഉൾപ്പെടെ, പതിപ്പ് 4-ന്റെ ആദ്യ കമാൻഡ് ലൈൻ റിലീസ് ഞങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ലഭ്യമാക്കി. കമാൻഡ് ലൈൻ ഉപയോഗം മുഴുവൻ ആപ്ലിക്കേഷനിലും സ്റ്റാൻഡേർഡ് ചെയ്തു. ഈ പുതിയ പതിപ്പിലേക്ക് അപ്‌ഗ്രേഡ് ചെയ്യുന്നതിന് സ്‌ക്രിപ്റ്റുകൾ അപ്‌ഡേറ്റ് ചെയ്യാൻ സമയമെടുക്കുക. കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ വിക്കിയിൽ ലഭ്യമാണ്.
സവിശേഷതകൾ
- എസ്എൻപികൾ, സിഎൻവികൾ, ഘടനാപരമായ വകഭേദങ്ങൾ എന്നിവ കണ്ടെത്തൽ
- ഒരു റഫറൻസ് ജീനോമിലേക്ക് റോ റീഡുകളുടെ വിന്യാസം
- VCF കൃത്രിമത്വം: പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനം, ലയിപ്പിക്കുക, ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക, താരതമ്യം ചെയ്യുക, ഫോർമാറ്റ് പരിവർത്തനം, ആക്ഷേപം
- SAM/BAM, VCF സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്സ് കണക്കുകൂട്ടലും പ്ലോട്ടിംഗും
- Demultiplexing വായിക്കുന്നു
- വ്യാഖ്യാനിച്ച ജീനോം അസംബ്ലികളുടെ വിന്യാസം
- GFF3 ഫോർമാറ്റിലുള്ള ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌റ്റോം ആൻപ്‌റ്റേഷനുകളെക്കുറിച്ചുള്ള സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകളും ഫിൽട്ടറിംഗും
പ്രേക്ഷകർ
ആരോഗ്യ സംരക്ഷണ വ്യവസായം, ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം, മറ്റ് പ്രേക്ഷകർ, കൃഷി
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
ജാവ SWT, കൺസോൾ/ടെർമിനൽ, എക്ലിപ്സ്
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
ജാവ
https://sourceforge.net/projects/ngsep/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
