Ini ialah arahan arden-analyse yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
arden-analyse - menganalisis hasil pemetaan genom rujukan tiruan
SINOPSIS
arden-analisis [pilihan] [INPUT FAIL] [OUTPUTFOLDER] ...
DESCRIPTION
Skrip untuk menganalisis hasil pemetaan genom rujukan tiruan. Skrip ini
mengenal pasti TP / FP yang diduga pada set data tertentu (dibaca).
PILIHAN
OUTPUTFOLDER
laluan ke folder destinasi output.
INPUT FAIL
ppath ke fail ini. Untuk mendapatkan format yang diperlukan, lihat contoh fail.
--versi
tunjukkan nombor versi program dan keluar
-h, - membantu
tunjukkan mesej bantuan ini dan keluar
-p PHRED, --phred=PHRED
Nyatakan pengekodan PHRED bagi bacaan input iaitu Illumina 1.3+ = -p 33.[lalai:
33]
-r PANGKAT, --pangkat dalaman=Rank
Gunakan kedudukan dalaman untuk bacaan (diperlukan jika nama bacaan tidak boleh
secara leksikografi diisih dengan cara yang sama dalam python dan OS anda oleh sam
alatan).[lalai:1]
Gunakan arden-analyse dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net