Ini ialah apl Linux bernama AmPEP dan AxPEP yang keluaran terbaharunya boleh dimuat turun sebagai deep-ampep30-test_set.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama AmPEP dan AxPEP ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN:
AmPEP dan AxPEP
HURAIAN:
Peptida antimikrobial (AMP) adalah calon yang menjanjikan dalam memerangi patogen tahan multidrug kerana pelbagai aktiviti dan ketoksikan yang rendah. Walau bagaimanapun, pengenalpastian AMP melalui eksperimen makmal basah masih mahal dan memakan masa. AmPEP ialah kaedah pengiraan yang tepat untuk ramalan AMP menggunakan algoritma hutan rawak. Model ramalan adalah berdasarkan corak pengedaran sifat asid amino di sepanjang jujukan. Model optimum kami, AmPEP dengan nisbah data 1:3 mencapai ketepatan yang sangat tinggi sebanyak 96%, MCC sebanyak 0.9, AUC-ROC sebanyak 0.99 dan statistik Kappa sebanyak 0.9. AmPEP mengatasi kaedah sedia ada berkenaan dengan ketepatan, MCC dan AUC-ROC apabila diuji menggunakan set data penanda aras.Ciri-ciri
- Kod sumber MATLAB
- set data AmPEP
- pembelajaran mesin
- Bioinformatik
- Urutan peptida
- Penemuan ubat
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/axpep/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.