Dit is de opdracht gt-matchtool die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
gt-matchtool - Parseer matchformaten en/of roep matchingtools op.
KORTE INHOUD
gt matchtool [optie ...]
PRODUCTBESCHRIJVING
-Type [...]
kies het matchbestandsformaat: OPENMATCH: open match formaat, bijvoorbeeld vmatch BLASTOUT: tabellarisch
BLAST-uitvoer (-m 8) BLASTALLP: roep BLASTALL aan met blastp BLASTALLN: roep BLASTALL aan
met blastn BLASTP: roep blastp aan BLASTN: roep blastn aan LAST: roep LAST SW aan: gebruik
Smith-Waterman (standaard: OPENMATCH)
-matchbestand [bestandsnaam]
invoerbestandsnaam instellen (standaard: ongedefinieerd)
-Db [bestandsnaam]
databasebestandsnaam instellen (standaard: ongedefinieerd)
-zwemlen [waarde]
stel de minimaal vereiste uitlijningslengte in (voor Smith-Waterman-uitlijning) (standaard: 10)
-swmaxedist [waarde]
stel de maximaal toegestane bewerkingsafstand in (voor Smith-Waterman-uitlijning) (standaard: 0)
-vraag [bestandsnaam]
stel de naam van het querybestand in (standaard: ongedefinieerd)
-Help
help weergeven en afsluiten
-versie
versie-informatie weergeven en afsluiten
RAPPORTAGE BUGS
Rapporteer bugs aangt-gebruikers@genometools.org>.
Gebruik gt-matchtool online met behulp van onworks.net-services