Dit is de Linux-app genaamd iPiG waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als ipig_r5.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd iPiG gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
iPiG
PRODUCTBESCHRIJVING
iPiG richt zich op de integratie van peptide spectrum matches (PSM's) van massaspectrometrie (MS)
peptide-identificaties in genomische visualisaties geleverd door genoombrowser zoals de UCSC-genoombrowser (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG neemt PSM's van het MS-standaardformaat mzIdentML (*.mzid) of in tekstformaat en levert resultaten in genoomtrackformaten (BED- en GFF3-bestanden), die eenvoudig in genoombrowsers kunnen worden geïmporteerd.
Voor meer details over iPiG en zijn functionaliteit, zie
"iPiG: integratie van peptidespectrumovereenkomsten in genoombrowservisualisaties"
Mathias Kuhring en Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Java Swing, console/terminal
Programmeertaal
Java
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/ipig/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
