Este é o comando arden-analyze que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas múltiplas estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online de Windows ou emulador online de MAC OS.
PROGRAMA:
NOME
arden-analyze - analisa os resultados do mapeamento artificial do genoma de referência
SINOPSE
análise de arden [opções] [INPUT ARQUIVO] [PASTA DE SAÍDA] ...
DESCRIÇÃO
Script para análise dos resultados do mapeamento do genoma de referência artificial. Este roteiro
identifica os supostos TPs/FPs em um conjunto de dados específico (leituras).
OPÇÕES
PASTA DE SAÍDA
caminho para a pasta de destino de saída.
INPUT ARQUIVO
ppath para o arquivo ini. Para obter o formato necessário, dê uma olhada nos arquivos de exemplo.
--versão
mostrar o número da versão do programa e sair
-h, --Socorro
mostre esta mensagem de ajuda e saia
-p PHRED, --phred=PHRED
Especifique a codificação PHRED das leituras de entrada, ou seja, Illumina 1.3+ = -p 33.[padrão:
33]
-r CLASSIFICAÇÃO, --internalrank=RANK
Use classificação interna para leituras (necessário se os nomes das leituras não puderem ser
lexicograficamente ser classificado da mesma maneira em python e seu sistema operacional por sam
ferramentas).[padrão:1]
Use arden-analyze online usando serviços onworks.net