Este é o comando ilink que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
ilink - procedimento de otimização GEMINI para encontrar um valor ideal local do vetor teta
de frações de recombinação
SINOPSE
iLink [opções] arquivo iped.dat arquivoped.dat
DESCRIÇÃO
Esta página de manual documenta resumidamente o iLink comando. Na verdade, esta é uma intenção muito crua
para fornecer uma página de manual porque a distribuição Debian GNU / Linux requer que cada programa
tem uma página de manual. Qualquer melhoria seria muito apreciada.
iLink faz parte do link rápido pacote de software.
ILINK usa o procedimento de otimização GEMINI para encontrar um valor ideal de teta localmente
vetor de frações de recombinação. Se você usar os scripts padrão produzidos pelo lcp, seu
estimativa inicial para theta é 1 em todas as dimensões. GEMINI avalia cada teta por seu
verossimilhança, procurando encontrar vetores teta com maior probabilidade de linhagem.
O procedimento GEMINI tem várias iterações. Cada iteração corresponde a uma linha de
saída. Cada iteração inclui várias avaliações de função de verossimilhança. Cada iteração
tem duas fases. Na Fase I GEMINI busca aprimorar o melhor theta atual. Na Fase II,
GEMINI estima o gradiente da probabilidade em relação ao melhor theta atual
vetor. Na primeira iteração, a Fase I avalia apenas a probabilidade no início
candidato theta.
Quando ILINK imprime uma linha como: maxcensor pode ser reduzido para -32767, ele foi concluído
a primeira avaliação da função de verossimilhança. Em longas corridas, esse fato pode ser usado para estimar
tempo de execução. Uma estimativa aproximada razoável para o número de avaliações de função é
10 * (número de dimensões do vetor teta). O número de dimensões do vetor teta é
um a menos que o número de loci na maioria dos casos. Se maletheta e femaletheta são permitidos
para diferir (sexdif é definido como 1), então o número de dimensões dobra para 2 * (número de
loci - 1). Estimar outros parâmetros (com fitmodel definido como verdadeiro) também pode aumentar o
número de dimensões.
Para saber mais sobre iLink pode ser útil ler o arquivo
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK se você tem um sistema Debian GNU / Linux.
OPÇÕES
Pode haver opções, mas não encontrei nenhuma informação sobre elas. Por favor avance
qualquer informação sobre eles paratile@debian.org>
Use ilink online usando serviços onworks.net