Aceasta este comanda arden-analyze care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
arden-analyze - analizează rezultatele cartografierii genomului de referință artificial
REZUMAT
arden-analiza [Opțiuni] [INTRARE FILE] [DOSAR DE IESIRE] ...
DESCRIERE
Script pentru a analiza rezultatele cartografierii genomului de referință artificial. Acest scenariu
identifică TP / FP presupuse pe un set de date specific (citește).
OPŢIUNI
DOSAR DE IESIRE
calea către folderul destinație de ieșire.
INTRARE FILE
ppath la fișierul ini. Pentru a obține formatul necesar, aruncați o privire la fișierele exemplu.
--versiune
afișați numărul versiunii programului și ieșiți
-h, --Ajutor
afișați acest mesaj de ajutor și ieșiți
-p PHRED, --phred=PHRED
Specificați codificarea PHRED a citirilor de intrare, adică Illumina 1.3+ = -p 33.[implicit:
33]
-r RANG, --internalrank=RANG
Utilizați clasarea internă pentru citiri (necesar dacă numele citite nu pot fi
lexicografic să fie sortat în același mod în python și sistemul de operare de sam
instrumente).[implicit:1]
Utilizați arden-analyse online folosind serviciile onworks.net