Aceasta este comanda gt-matchtool care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
gt-matchtool - Analizați formatele de potrivire și/sau invocați instrumente de potrivire.
REZUMAT
gt unealta de chibrituri [opțiune ...]
DESCRIERE
-Tip [...]
alegeți formatul fișierului de potrivire: OPENMATCH: deschide Meci format, de exemplu vmatch BLASTOUT : tabular
Ieșire BLAST (-m 8) BLASTALLP: invocați BLASTALL cu blastp BLASTALLN: invocați BLASTALL
cu blastn BLASTP : invoca blastp BLASTN : invoca blastn LAST : invoca LAST SW : foloseste
Smith-Waterman (implicit: OPENMATCH)
-matchfile [nume de fișier]
setați numele fișierului de intrare (implicit: nedefinit)
-db [nume de fișier]
setați numele fișierului bazei de date (implicit: nedefinit)
-swminlen [valoare]
setați lungimea minimă de aliniere necesară (pentru alinierea Smith-Waterman) (implicit: 10)
-swmaxedist [valoare]
setați distanța de editare maximă permisă (pentru alinierea Smith-Waterman) (implicit: 0)
-interogare [nume de fișier]
setați numele fișierului de interogare (implicit: nedefinit)
-Ajutor
afișați ajutor și ieșiți
-versiune
afișați informații despre versiune și ieșiți
RAPORTAREA GANDACI
Raportați erori lagt-users@genometools.org>.
Utilizați gt-matchtool online folosind serviciile onworks.net